30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2202 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2202  conserved hypothetical protein; putative secreted protein  100 
 
 		 135 aa  261  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.184904  normal  0.817106 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2245  hypothetical protein  85.19 
 
 		 135 aa  201  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.702566  normal  0.472151 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2520  hypothetical protein  85.93 
 
 		 135 aa  190  5e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3735  hypothetical protein  70.41 
 
 		 135 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.722442  normal  0.0462573 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4456  hypothetical protein  62.73 
 
 		 133 aa  110  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696256 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2903  hypothetical protein  42.2 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.203392  normal  0.153041 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2190  hypothetical protein  35.54 
 
 		 158 aa  80.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3997  hypothetical protein  29.93 
 
 		 161 aa  80.1  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2142  hypothetical protein  35.54 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0415  hypothetical protein  36.13 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0438215  hitchhiker  0.000233911 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0940  hypothetical protein  31.43 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0606896  hitchhiker  0.00778912 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0383  hypothetical protein  39.13 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00782707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1081  hypothetical protein  38.46 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129849 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5640  hypothetical protein  36.17 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00146587  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2359  hypothetical protein  32.88 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0847029  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0919  hypothetical protein  33.66 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.404023  normal  0.0701309 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0934  hypothetical protein  29.66 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1867  hypothetical protein  36.7 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0724  hypothetical protein  30.51 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.108952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2301  hypothetical protein  31.3 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3971  hypothetical protein  37.5 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1905  hypothetical protein  32.17 
 
 		 183 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.539779 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2001  hypothetical protein  32.17 
 
 		 183 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2661  hypothetical protein  29.73 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.343805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6041  hypothetical protein  27.73 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.970972  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0866  hypothetical protein  27.73 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.171288  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2922  hypothetical protein  29.73 
 
 		 171 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0898761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3299  hypothetical protein  31.47 
 
 		 183 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.43455 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2396  hypothetical protein  31.47 
 
 		 193 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1032  hypothetical protein  32.94 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>