26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0064 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0064  hypothetical protein  100 
 
 		 457 aa  900    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583147 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1581  putative type IV prepilin  30.37 
 
 		 482 aa  103  7e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1761  putative type IV prepilin  30.55 
 
 		 512 aa  101  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2071  prepilin-type N- cleavage/methylation domain protein  33.03 
 
 		 478 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00288729  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6558  hypothetical protein  26.58 
 
 		 404 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1510  prepilin  27.48 
 
 		 468 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4478  type IV pilus protein PilV  27.7 
 
 		 459 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59350  Type IV B pilus protein  26.79 
 
 		 442 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00610666  hitchhiker  0.0000000000033381 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7249  hypothetical protein  28.09 
 
 		 426 aa  50.1  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  28.85 
 
 		 150 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  28.85 
 
 		 150 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  28.85 
 
 		 150 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0234  general secretion pathway protein G  30.7 
 
 		 146 aa  46.2  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  29.73 
 
 		 163 aa  45.8  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5558  hypothetical protein  34.12 
 
 		 400 aa  45.8  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363207  normal  0.0854155 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0144  general secretion pathway protein G  31.4 
 
 		 166 aa  44.7  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  27.88 
 
 		 150 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  27.88 
 
 		 150 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  27.88 
 
 		 150 aa  44.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  29.92 
 
 		 156 aa  43.5  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  28.83 
 
 		 150 aa  43.5  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  27.88 
 
 		 154 aa  43.5  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0001  shufflon protein, N-terminal constant region  21.85 
 
 		 418 aa  43.1  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  27.78 
 
 		 144 aa  43.1  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1432  type II secretion systen protein G  30.48 
 
 		 209 aa  43.5  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.909605 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5430  putative adhesin precursor  26.36 
 
 		 412 aa  43.1  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>