23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2000 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2000  DNA/RNA-binding protein albA  100 
 
 		 92 aa  181  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.861936  normal  0.151075 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1454  DNA/RNA-binding protein albA  85.39 
 
 		 91 aa  147  4e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.151836  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1400  DNA/RNA-binding protein albA  84.88 
 
 		 97 aa  146  8e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0373029  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1496  DNA/RNA-binding protein albA  80.46 
 
 		 94 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.930006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0713  nucleoid protein Alba  67.86 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.35308  normal  0.255559 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1656  DNA-binding protein Alba  66.67 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0019  DNA-binding protein Alba  60 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1056  DNA/RNA-binding protein albA  63.22 
 
 		 89 aa  101  4e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1795  DNA/RNA-binding protein albA  62.07 
 
 		 89 aa  100  6e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0861  DNA/RNA-binding protein albA  62.07 
 
 		 89 aa  100  6e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.349399  hitchhiker  0.00375507 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0923  DNA/RNA-binding protein albA  60.47 
 
 		 89 aa  97.4  6e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1325  DNA/RNA-binding protein albA  51.69 
 
 		 91 aa  87  9e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1940  DNA-binding protein Alba  49.41 
 
 		 97 aa  80.1  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.13078  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0211  DNA-binding protein Alba  51.14 
 
 		 91 aa  78.2  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.989773  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0535  DNA-binding protein Alba  52.81 
 
 		 93 aa  77.8  0.00000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1747  DNA/RNA-binding protein albA  50.6 
 
 		 98 aa  76.3  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.597618  normal  0.398365 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1396  DNA/RNA-binding protein albA  41.57 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0857  DNA/RNA-binding protein albA  41.57 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.150501 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1922  DNA/RNA-binding protein albA  40.45 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.511261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0947  DNA/RNA-binding protein albA  39.33 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1226  DNA/RNA-binding protein albA  42.05 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000000359102  normal  0.582935 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0255  DNA/RNA-binding protein AlbA  44.05 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.841693 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0644  DNA-binding protein  39.73 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>