23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0713 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0713  nucleoid protein Alba  100 
 
 		 89 aa  176  9e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.35308  normal  0.255559 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2000  DNA/RNA-binding protein albA  67.86 
 
 		 92 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.861936  normal  0.151075 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1400  DNA/RNA-binding protein albA  65.12 
 
 		 97 aa  114  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0373029  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1454  DNA/RNA-binding protein albA  65.52 
 
 		 91 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.151836  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1496  DNA/RNA-binding protein albA  62.35 
 
 		 94 aa  107  8.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.930006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1656  DNA-binding protein Alba  62.07 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0019  DNA-binding protein Alba  49.43 
 
 		 90 aa  90.5  7e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1795  DNA/RNA-binding protein albA  52.27 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0923  DNA/RNA-binding protein albA  54.55 
 
 		 89 aa  87.8  5e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1056  DNA/RNA-binding protein albA  53.41 
 
 		 89 aa  87.8  5e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0861  DNA/RNA-binding protein albA  52.27 
 
 		 89 aa  87.4  6e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.349399  hitchhiker  0.00375507 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1940  DNA-binding protein Alba  48.28 
 
 		 97 aa  75.5  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.13078  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0211  DNA-binding protein Alba  52.33 
 
 		 91 aa  74.7  0.0000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.989773  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1325  DNA/RNA-binding protein albA  45.56 
 
 		 91 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0535  DNA-binding protein Alba  44.94 
 
 		 93 aa  72  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1747  DNA/RNA-binding protein albA  43.68 
 
 		 98 aa  70.1  0.000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.597618  normal  0.398365 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0857  DNA/RNA-binding protein albA  43.68 
 
 		 92 aa  65.1  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.150501 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1396  DNA/RNA-binding protein albA  43.68 
 
 		 92 aa  65.1  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1922  DNA/RNA-binding protein albA  42.53 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.511261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0947  DNA/RNA-binding protein albA  41.38 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0255  DNA/RNA-binding protein AlbA  42.05 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.841693 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1226  DNA/RNA-binding protein albA  38.2 
 
 		 94 aa  51.6  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000000359102  normal  0.582935 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0644  DNA-binding protein  38.96 
 
 		 77 aa  46.2  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>