19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0644 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0644  DNA-binding protein  100 
 
 		 77 aa  149  2e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0255  DNA/RNA-binding protein AlbA  50 
 
 		 95 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.841693 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1795  DNA/RNA-binding protein albA  44.87 
 
 		 89 aa  60.5  0.000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1056  DNA/RNA-binding protein albA  45.57 
 
 		 89 aa  60.1  0.000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0861  DNA/RNA-binding protein albA  44.3 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.349399  hitchhiker  0.00375507 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0019  DNA-binding protein Alba  40.51 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1940  DNA-binding protein Alba  42.31 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.13078  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1747  DNA/RNA-binding protein albA  41.03 
 
 		 98 aa  51.2  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.597618  normal  0.398365 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0923  DNA/RNA-binding protein albA  40.51 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0211  DNA-binding protein Alba  35.9 
 
 		 91 aa  47.4  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.989773  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1325  DNA/RNA-binding protein albA  34.57 
 
 		 91 aa  47  0.00009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0713  nucleoid protein Alba  38.96 
 
 		 89 aa  46.2  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.35308  normal  0.255559 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0535  DNA-binding protein Alba  36.99 
 
 		 93 aa  46.2  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1656  DNA-binding protein Alba  41.03 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1922  DNA/RNA-binding protein albA  34.72 
 
 		 108 aa  42  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.511261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2000  DNA/RNA-binding protein albA  39.73 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.861936  normal  0.151075 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0857  DNA/RNA-binding protein albA  33.8 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.150501 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1396  DNA/RNA-binding protein albA  33.8 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0947  DNA/RNA-binding protein albA  35.21 
 
 		 92 aa  40.4  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>