25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1656 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1656  DNA-binding protein Alba  100 
 
 		 89 aa  175  2e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1454  DNA/RNA-binding protein albA  68.97 
 
 		 91 aa  119  9e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.151836  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1400  DNA/RNA-binding protein albA  65.88 
 
 		 97 aa  114  5e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0373029  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0019  DNA-binding protein Alba  64.71 
 
 		 90 aa  114  6e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1496  DNA/RNA-binding protein albA  65.52 
 
 		 94 aa  113  7.999999999999999e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.930006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2000  DNA/RNA-binding protein albA  66.67 
 
 		 92 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.861936  normal  0.151075 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0713  nucleoid protein Alba  62.07 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.35308  normal  0.255559 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0535  DNA-binding protein Alba  65.85 
 
 		 93 aa  95.9  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0923  DNA/RNA-binding protein albA  56.82 
 
 		 89 aa  94.7  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1056  DNA/RNA-binding protein albA  57.95 
 
 		 89 aa  94.4  4e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1795  DNA/RNA-binding protein albA  56.82 
 
 		 89 aa  94.7  4e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0861  DNA/RNA-binding protein albA  56.82 
 
 		 89 aa  94  6e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.349399  hitchhiker  0.00375507 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0211  DNA-binding protein Alba  59.09 
 
 		 91 aa  86.7  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.989773  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1325  DNA/RNA-binding protein albA  47.78 
 
 		 91 aa  84  6e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1940  DNA-binding protein Alba  47.73 
 
 		 97 aa  82  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.13078  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1747  DNA/RNA-binding protein albA  47.19 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.597618  normal  0.398365 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0857  DNA/RNA-binding protein albA  48.31 
 
 		 92 aa  76.6  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.150501 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1922  DNA/RNA-binding protein albA  47.19 
 
 		 108 aa  75.5  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.511261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1396  DNA/RNA-binding protein albA  48.31 
 
 		 92 aa  75.9  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0947  DNA/RNA-binding protein albA  46.07 
 
 		 92 aa  73.2  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1226  DNA/RNA-binding protein albA  43.68 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000000359102  normal  0.582935 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0255  DNA/RNA-binding protein AlbA  42.17 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.841693 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1749  Alba, DNA/RNA-binding protein  43.33 
 
 		 119 aa  46.2  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000169596  normal  0.0432142 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0644  DNA-binding protein  41.03 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1261  Alba, DNA/RNA-binding protein  37.35 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>