24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1400 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1400  DNA/RNA-binding protein albA  100 
 
 		 97 aa  194  5.000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0373029  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1454  DNA/RNA-binding protein albA  84.44 
 
 		 91 aa  153  8e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.151836  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2000  DNA/RNA-binding protein albA  84.88 
 
 		 92 aa  146  8e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.861936  normal  0.151075 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1496  DNA/RNA-binding protein albA  80.68 
 
 		 94 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.930006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1656  DNA-binding protein Alba  65.88 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0713  nucleoid protein Alba  65.12 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.35308  normal  0.255559 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0019  DNA-binding protein Alba  62.65 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0923  DNA/RNA-binding protein albA  60.47 
 
 		 89 aa  96.3  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1795  DNA/RNA-binding protein albA  60.92 
 
 		 89 aa  94.4  5e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0861  DNA/RNA-binding protein albA  60.92 
 
 		 89 aa  93.6  8e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.349399  hitchhiker  0.00375507 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1056  DNA/RNA-binding protein albA  59.77 
 
 		 89 aa  92.8  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1940  DNA-binding protein Alba  51.04 
 
 		 97 aa  90.1  9e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.13078  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0535  DNA-binding protein Alba  53.26 
 
 		 93 aa  89.4  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1747  DNA/RNA-binding protein albA  51.09 
 
 		 98 aa  85.5  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.597618  normal  0.398365 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1325  DNA/RNA-binding protein albA  51.16 
 
 		 91 aa  84.7  4e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0211  DNA-binding protein Alba  51.14 
 
 		 91 aa  76.3  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.989773  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1922  DNA/RNA-binding protein albA  41.49 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.511261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0857  DNA/RNA-binding protein albA  43.02 
 
 		 92 aa  66.6  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.150501 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1396  DNA/RNA-binding protein albA  43.02 
 
 		 92 aa  66.6  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0947  DNA/RNA-binding protein albA  40.7 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0255  DNA/RNA-binding protein AlbA  41.57 
 
 		 95 aa  57  0.00000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.841693 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1226  DNA/RNA-binding protein albA  41.49 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000000359102  normal  0.582935 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0933  DNA/RNA-binding protein AlbA  38.64 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.24022 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1942  Alba, DNA/RNA-binding protein  39.34 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.939728  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>