26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0535 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0535  DNA-binding protein Alba  100 
 
 		 93 aa  177  4e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0211  DNA-binding protein Alba  69.32 
 
 		 91 aa  115  3e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.989773  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1656  DNA-binding protein Alba  65.85 
 
 		 89 aa  95.9  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1940  DNA-binding protein Alba  53.49 
 
 		 97 aa  94.7  4e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.13078  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1747  DNA/RNA-binding protein albA  54.65 
 
 		 98 aa  94  6e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.597618  normal  0.398365 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0857  DNA/RNA-binding protein albA  54.02 
 
 		 92 aa  92  3e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.150501 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1922  DNA/RNA-binding protein albA  52.87 
 
 		 108 aa  90.9  5e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.511261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1396  DNA/RNA-binding protein albA  52.87 
 
 		 92 aa  90.5  6e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1454  DNA/RNA-binding protein albA  53.93 
 
 		 91 aa  90.1  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.151836  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0947  DNA/RNA-binding protein albA  51.72 
 
 		 92 aa  89.4  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1056  DNA/RNA-binding protein albA  55.06 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1400  DNA/RNA-binding protein albA  53.26 
 
 		 97 aa  89.4  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0373029  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0861  DNA/RNA-binding protein albA  53.93 
 
 		 89 aa  88.2  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.349399  hitchhiker  0.00375507 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0923  DNA/RNA-binding protein albA  58.14 
 
 		 89 aa  88.2  3e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1795  DNA/RNA-binding protein albA  53.93 
 
 		 89 aa  87.4  5e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1226  DNA/RNA-binding protein albA  53.93 
 
 		 94 aa  87  7e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000000359102  normal  0.582935 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0019  DNA-binding protein Alba  52.27 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1496  DNA/RNA-binding protein albA  58.62 
 
 		 94 aa  85.1  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.930006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2000  DNA/RNA-binding protein albA  52.81 
 
 		 92 aa  77.8  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.861936  normal  0.151075 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1325  DNA/RNA-binding protein albA  42.86 
 
 		 91 aa  72.8  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0713  nucleoid protein Alba  44.94 
 
 		 89 aa  72  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.35308  normal  0.255559 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0255  DNA/RNA-binding protein AlbA  39.56 
 
 		 95 aa  60.1  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.841693 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1261  Alba, DNA/RNA-binding protein  38.82 
 
 		 95 aa  52.8  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0644  DNA-binding protein  36.99 
 
 		 77 aa  46.2  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1942  Alba, DNA/RNA-binding protein  39.24 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.939728  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1749  Alba, DNA/RNA-binding protein  41.67 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000169596  normal  0.0432142 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>