22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1454 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1454  DNA/RNA-binding protein albA  100 
 
 		 91 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.151836  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1400  DNA/RNA-binding protein albA  84.44 
 
 		 97 aa  153  8e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0373029  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2000  DNA/RNA-binding protein albA  85.39 
 
 		 92 aa  147  4e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.861936  normal  0.151075 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1496  DNA/RNA-binding protein albA  78.02 
 
 		 94 aa  142  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.930006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1656  DNA-binding protein Alba  68.97 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0713  nucleoid protein Alba  65.52 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.35308  normal  0.255559 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0019  DNA-binding protein Alba  61.18 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0923  DNA/RNA-binding protein albA  60.47 
 
 		 89 aa  100  5e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1795  DNA/RNA-binding protein albA  60.92 
 
 		 89 aa  99.8  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1056  DNA/RNA-binding protein albA  62.07 
 
 		 89 aa  99.8  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0861  DNA/RNA-binding protein albA  60.92 
 
 		 89 aa  99.4  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.349399  hitchhiker  0.00375507 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0535  DNA-binding protein Alba  53.93 
 
 		 93 aa  90.1  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1940  DNA-binding protein Alba  50 
 
 		 97 aa  86.7  9e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.13078  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1325  DNA/RNA-binding protein albA  49.44 
 
 		 91 aa  84.7  4e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1747  DNA/RNA-binding protein albA  50 
 
 		 98 aa  83.2  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.597618  normal  0.398365 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0211  DNA-binding protein Alba  52.27 
 
 		 91 aa  81.3  0.000000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.989773  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1396  DNA/RNA-binding protein albA  42.39 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0857  DNA/RNA-binding protein albA  42.39 
 
 		 92 aa  68.2  0.00000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.150501 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1922  DNA/RNA-binding protein albA  41.3 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.511261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0947  DNA/RNA-binding protein albA  40.22 
 
 		 92 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1226  DNA/RNA-binding protein albA  44.83 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000000359102  normal  0.582935 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0255  DNA/RNA-binding protein AlbA  42.17 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.841693 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>