24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0947 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0947  DNA/RNA-binding protein albA  100 
 
 		 92 aa  181  3e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0857  DNA/RNA-binding protein albA  95.65 
 
 		 92 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.150501 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1922  DNA/RNA-binding protein albA  95.65 
 
 		 108 aa  176  1e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.511261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1396  DNA/RNA-binding protein albA  94.57 
 
 		 92 aa  175  2e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1226  DNA/RNA-binding protein albA  77.01 
 
 		 94 aa  125  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000000359102  normal  0.582935 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0535  DNA-binding protein Alba  51.72 
 
 		 93 aa  89.4  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0019  DNA-binding protein Alba  49.43 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0211  DNA-binding protein Alba  53.93 
 
 		 91 aa  85.5  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.989773  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1940  DNA-binding protein Alba  46.99 
 
 		 97 aa  85.5  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.13078  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1747  DNA/RNA-binding protein albA  47.62 
 
 		 98 aa  83.2  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.597618  normal  0.398365 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1056  DNA/RNA-binding protein albA  42.53 
 
 		 89 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0861  DNA/RNA-binding protein albA  41.38 
 
 		 89 aa  73.9  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.349399  hitchhiker  0.00375507 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1656  DNA-binding protein Alba  46.07 
 
 		 89 aa  73.2  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1795  DNA/RNA-binding protein albA  40.23 
 
 		 89 aa  70.5  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0923  DNA/RNA-binding protein albA  39.08 
 
 		 89 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2000  DNA/RNA-binding protein albA  39.33 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.861936  normal  0.151075 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1454  DNA/RNA-binding protein albA  40.22 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.151836  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1400  DNA/RNA-binding protein albA  40.7 
 
 		 97 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0373029  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0713  nucleoid protein Alba  41.38 
 
 		 89 aa  63.2  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.35308  normal  0.255559 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1496  DNA/RNA-binding protein albA  38.2 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.930006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1325  DNA/RNA-binding protein albA  36.05 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0255  DNA/RNA-binding protein AlbA  37.08 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.841693 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1261  Alba, DNA/RNA-binding protein  34.52 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0644  DNA-binding protein  35.21 
 
 		 77 aa  40.4  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>