25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1940 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1940  DNA-binding protein Alba  100 
 
 		 97 aa  190  5e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.13078  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1747  DNA/RNA-binding protein albA  88.66 
 
 		 98 aa  171  2.9999999999999996e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.597618  normal  0.398365 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0019  DNA-binding protein Alba  52.27 
 
 		 90 aa  96.7  9e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0535  DNA-binding protein Alba  53.49 
 
 		 93 aa  94.7  4e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1496  DNA/RNA-binding protein albA  55.42 
 
 		 94 aa  91.3  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.930006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0861  DNA/RNA-binding protein albA  53.93 
 
 		 89 aa  91.3  4e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.349399  hitchhiker  0.00375507 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1056  DNA/RNA-binding protein albA  52.81 
 
 		 89 aa  90.5  7e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1400  DNA/RNA-binding protein albA  51.04 
 
 		 97 aa  90.1  9e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0373029  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0923  DNA/RNA-binding protein albA  52.81 
 
 		 89 aa  90.1  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1396  DNA/RNA-binding protein albA  51.81 
 
 		 92 aa  89  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0857  DNA/RNA-binding protein albA  50.6 
 
 		 92 aa  88.6  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.150501 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1795  DNA/RNA-binding protein albA  52.81 
 
 		 89 aa  88.6  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1922  DNA/RNA-binding protein albA  45.74 
 
 		 108 aa  88.6  3e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.511261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1454  DNA/RNA-binding protein albA  50 
 
 		 91 aa  86.7  9e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.151836  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0947  DNA/RNA-binding protein albA  46.99 
 
 		 92 aa  85.5  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1325  DNA/RNA-binding protein albA  48.31 
 
 		 91 aa  82.8  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1656  DNA-binding protein Alba  47.73 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0211  DNA-binding protein Alba  51.16 
 
 		 91 aa  80.5  0.000000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.989773  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2000  DNA/RNA-binding protein albA  49.41 
 
 		 92 aa  80.1  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.861936  normal  0.151075 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0713  nucleoid protein Alba  48.28 
 
 		 89 aa  75.5  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.35308  normal  0.255559 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1226  DNA/RNA-binding protein albA  41.86 
 
 		 94 aa  70.9  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000000359102  normal  0.582935 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0255  DNA/RNA-binding protein AlbA  41.38 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.841693 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0644  DNA-binding protein  42.31 
 
 		 77 aa  55.5  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1942  Alba, DNA/RNA-binding protein  36.11 
 
 		 89 aa  50.4  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.939728  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1261  Alba, DNA/RNA-binding protein  40.7 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>