16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0548 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0548  RNA polymerase Rpb4  100 
 
 		 116 aa  233  5.0000000000000005e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160889  normal  0.500611 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1873  RNA polymerase Rpb4  72.41 
 
 		 116 aa  179  9.000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.339371 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1960  RNA polymerase Rpb4  73.28 
 
 		 116 aa  175  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3027  RNA polymerase Rpb4  59.48 
 
 		 117 aa  153  7e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1569  DNA-directed RNA polymerase, subunit F  54.31 
 
 		 122 aa  120  6e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0257686 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3232  DNA-directed RNA polymerase, subunit F  53.98 
 
 		 129 aa  120  7e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0033159  normal  0.0783497 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0904  DNA-directed RNA polymerase, subunit F  53.98 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000000866126  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0994  RNA polymerase Rpb4  50.89 
 
 		 115 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.242565  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0623  RNA polymerase Rpb4  49.12 
 
 		 118 aa  106  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.570875  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2389  RNA polymerase Rpb4  43.36 
 
 		 118 aa  105  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2673  RNA polymerase Rpb4  42.98 
 
 		 118 aa  100  8e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.406988 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1097  RNA polymerase Rpb4  42.48 
 
 		 118 aa  99.8  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.385582  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2278  RNA polymerase Rpb4  41.59 
 
 		 118 aa  91.3  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.452982  normal  0.153083 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0764  RNA polymerase Rpb4  33.33 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0062  DNA-directed RNA polymerase, subunit F  36.49 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.20245  normal  0.0943991 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1982  RNA polymerase Rpb4  31.08 
 
 		 115 aa  45.4  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.583012  normal  0.968231 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>