32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4864 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4864  putative depolymerase  100 
 
 		 404 aa  830    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5556  putative depolymerase  76.01 
 
 		 403 aa  625  1e-178  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1647  putative depolymerase  55.84 
 
 		 391 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.543513  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0127  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  31.82 
 
 		 347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3159  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  30.47 
 
 		 340 aa  148  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1585  putative depolymerase  33.16 
 
 		 362 aa  145  9e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0731101  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2417  Fibronectin type III domain protein  28.76 
 
 		 485 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2303  polyhydroxybutyrate depolymerase  31.03 
 
 		 348 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1977  polyhydroxybutyrate depolymerase  28.13 
 
 		 369 aa  124  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2068  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  29.52 
 
 		 358 aa  124  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.151389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02265  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  26.98 
 
 		 353 aa  122  8e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34710  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase protein  28.07 
 
 		 338 aa  120  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.222008  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1238  fibronectin, type III domain-containing protein  28.3 
 
 		 485 aa  120  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.109718  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2280  hypothetical protein  31.03 
 
 		 341 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70217  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0176  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  28.09 
 
 		 375 aa  119  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2089  polyhydroxybutyrate depolymerase  31.03 
 
 		 341 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2146  polyhydroxybutyrate depolymerase  31.03 
 
 		 341 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.286329  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5328  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  29.2 
 
 		 317 aa  113  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4785  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  26.79 
 
 		 374 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4259  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  26.79 
 
 		 322 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00982049 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1082  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  26.68 
 
 		 352 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4772  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  26.52 
 
 		 356 aa  98.6  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.826591 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0665  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  26.14 
 
 		 355 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.097547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5512  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  26.4 
 
 		 387 aa  93.6  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.292347 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2065  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  27.85 
 
 		 506 aa  92.4  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.140778  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07987  polyhydroxybutyrate depolymerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03560)  28.65 
 
 		 377 aa  88.6  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.445833  normal  0.346264 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2373  fibronectin, type III domain-containing protein  31.48 
 
 		 385 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2204  esterase, PHB depolymerase  29.13 
 
 		 367 aa  45.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.667331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2991  PHB depolymerase family esterase  27.91 
 
 		 419 aa  43.5  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2576  esterase, PHB depolymerase  26.26 
 
 		 396 aa  43.5  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.225739  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3990  Poly (3-hydroxybutyrate ) depolymerase  30.1 
 
 		 396 aa  43.9  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1969  esterase, PHB depolymerase  27.35 
 
 		 373 aa  43.5  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.127109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>