More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0741 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0741  carbonic anhydrase  100 
 
 
343 aa  674    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.597071  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1749  carbonic anhydrase  77.06 
 
 
356 aa  474  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1785  carbonic anhydrase  60.53 
 
 
340 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0548346 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1506  carbonic anhydrase  60.53 
 
 
368 aa  397  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.787376  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1506  carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  59.82 
 
 
340 aa  390  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0349628  normal  0.892424 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2259  carbonic anhydrase  58.72 
 
 
339 aa  381  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.288291  normal  0.676633 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0545  carbonic anhydrase  46.73 
 
 
340 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.421322  hitchhiker  0.00175013 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3659  carbonic anhydrase  45.9 
 
 
347 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0725502  normal  0.181373 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5022  carbonic anhydrase  47.31 
 
 
348 aa  249  4e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.585067  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0053  anhydrase family 3 protein  39.74 
 
 
179 aa  102  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.389701  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1611  transferase hexapeptide repeat protein  37.09 
 
 
175 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1516  transferase hexapeptide repeat protein  37.09 
 
 
175 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.159482  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2353  hexapaptide repeat-containing transferase  37.09 
 
 
175 aa  99.4  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0623  hypothetical protein  35.03 
 
 
180 aa  99.4  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000022748  normal  0.0528522 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3876  hypothetical protein  35.03 
 
 
180 aa  99.4  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000917644  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0322  hexapaptide repeat-containing transferase  35.03 
 
 
180 aa  98.6  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287366  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0044  hexapaptide repeat-containing transferase  37.86 
 
 
181 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0401  anhydrase family 3 protein  43.61 
 
 
179 aa  97.4  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0233  carbonic anhydrase  36.6 
 
 
179 aa  97.1  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00386498  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0145  hypothetical protein  37.14 
 
 
181 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0030  anhydrase family 3 protein  40.79 
 
 
185 aa  97.1  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0126  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.27 
 
 
185 aa  96.3  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.98983  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2395  hexapaptide repeat-containing transferase  36.77 
 
 
176 aa  95.5  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1326  hypothetical protein  40.67 
 
 
177 aa  94.7  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.672579  normal  0.329427 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5080  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  32.28 
 
 
170 aa  94.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.186899 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0113  transferase  36.36 
 
 
182 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164534  normal  0.0870058 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1678  carbonic anhydrase  30.71 
 
 
172 aa  94.7  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0095  anhydrase family 3 protein  35.66 
 
 
182 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425892 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0110  carbonic anhydrase  35.66 
 
 
182 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0110  transferase  35.66 
 
 
182 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103264 
 
 
-
 
NC_002950  PG1211  hexapeptide transferase family protein  35.4 
 
 
192 aa  93.6  4e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.534657 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1122  putative transferase  35.71 
 
 
179 aa  93.6  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000279572  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1087  carbonic anhydrase  32.39 
 
 
182 aa  93.6  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.862883  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0066  hypothetical protein  35.1 
 
 
180 aa  94  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0091  hexapaptide repeat-containing transferase  39.33 
 
 
181 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00780  hypothetical protein  35.1 
 
 
180 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0319  hexapaptide repeat-containing transferase  37.14 
 
 
179 aa  93.2  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1242  hypothetical protein  31.79 
 
 
174 aa  92.8  8e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0037  carbonic anhydrase  32.69 
 
 
182 aa  92.8  8e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198121  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0042  carbonic anhydrase  32.69 
 
 
182 aa  92.4  9e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000454133  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0223  hypothetical protein  32.89 
 
 
169 aa  92  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453095  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0613  hypothetical protein  39.55 
 
 
177 aa  92  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0041  carbonic anhydrase, family 3  32.69 
 
 
182 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000508164  unclonable  0.00000000000448586 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3658  acetyltransferase/carbonic anhydrase  29.94 
 
 
175 aa  92.4  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4460  carbonic anhydrase  36.69 
 
 
180 aa  92  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0041  carbonic anhydrase  32.05 
 
 
182 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000411727  unclonable  0.00000997439 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0363  putative transferase  36.94 
 
 
178 aa  91.7  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141387  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4505  putative transferase  34.39 
 
 
180 aa  91.3  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000187962  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0045  carbonic anhydrase  32.02 
 
 
182 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000141842  hitchhiker  0.0000010839 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2432  carbonic anhydrase  36.54 
 
 
189 aa  90.5  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5112  hexapaptide repeat-containing transferase  37.25 
 
 
174 aa  90.1  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.846878 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2797  carbonic anhydrase  36.84 
 
 
180 aa  89.4  8e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0037  carbonic anhydrase  33.54 
 
 
181 aa  89.4  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000544891  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01130  Trimeric LpxA-like superfamily protein  36.73 
 
 
192 aa  89.4  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0629  hypothetical protein  39.55 
 
 
178 aa  89.4  9e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0034  carbonic anhydrase  31.41 
 
 
182 aa  89.4  9e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000602369  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2556  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.88 
 
 
174 aa  89.4  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.025307  normal  0.273824 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0042  carbonic anhydrase  31.46 
 
 
182 aa  89  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0106  carbonic anhydrase family 3  34.62 
 
 
187 aa  89  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35304  predicted protein  39.1 
 
 
175 aa  89  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1520  hexapaptide repeat-containing transferase  40.52 
 
 
175 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000102664  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1414  transferase hexapeptide repeat containing protein  32.19 
 
 
169 aa  87.8  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00000109876  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0858  hexapaptide repeat-containing transferase  30.97 
 
 
172 aa  87.8  2e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1929  hexapaptide repeat-containing transferase  33.12 
 
 
182 aa  88.6  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000963233  hitchhiker  0.00946276 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0054  carbonic anhydrase  31.52 
 
 
182 aa  87.4  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000373213  normal  0.14059 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0039  carbonic anhydrase  30.86 
 
 
182 aa  87.8  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000072443  hitchhiker  0.000629469 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0037  carbonic anhydrase  30.86 
 
 
182 aa  87.4  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000433363  hitchhiker  0.00243914 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2271  acetyltransferase  34.78 
 
 
173 aa  87.8  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3782  putative transferase  34.38 
 
 
182 aa  87.4  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00339373  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0624  carbonic anhydrase  31.37 
 
 
171 aa  87  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000010495  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2015  hypothetical protein  36.6 
 
 
174 aa  86.7  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.755225  normal  0.649207 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0042  carbonic anhydrase  31.41 
 
 
185 aa  86.7  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000058127  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0535  transferase hexapeptide repeat containing protein  36.36 
 
 
166 aa  86.7  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000389901  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4073  acetyltransferase/carbonic anhydrase  32.05 
 
 
175 aa  86.7  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.213476  hitchhiker  0.00780432 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1066  hexapeptide transferase family protein  29.87 
 
 
170 aa  86.3  6e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2463  carbonic anhydrase  37.5 
 
 
184 aa  86.3  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000149932  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2138  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.81 
 
 
180 aa  86.7  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.126739 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3961  putative transferase  33.75 
 
 
182 aa  86.3  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000707478  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3711  putative transferase  28.92 
 
 
184 aa  86.3  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000368449  normal  0.0573377 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0049  carbonic anhydrase  38.94 
 
 
180 aa  86.3  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00044877  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3725  carbonic anhydrase  32.24 
 
 
185 aa  85.9  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00601402  hitchhiker  0.00871836 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0249  acetyltransferase  32.39 
 
 
177 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0446  putative transferase  33.76 
 
 
178 aa  85.5  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000031956  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0045  carbonic anhydrase  32.05 
 
 
184 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000362772  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2735  acetyltransferase  31.29 
 
 
184 aa  85.5  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1447  hexapaptide repeat-containing transferase  31.93 
 
 
183 aa  85.5  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00240912  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3324  hexapeptide transferase family protein  31.85 
 
 
186 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03130  hypothetical protein  34.18 
 
 
184 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000042792  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0434  putative transferase  34.18 
 
 
184 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000121267  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2224  transferase family protein  30.52 
 
 
173 aa  85.1  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.076272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4655  transferase family protein  29.94 
 
 
170 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4511  transferase; acetyltransferase/acyltransferase  29.94 
 
 
170 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4603  hypothetical protein  34.18 
 
 
184 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254067  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0426  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  27.39 
 
 
176 aa  84.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5010  transferase family protein  29.94 
 
 
170 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4879  transferase family protein  29.94 
 
 
170 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4870  transferase family protein  30.72 
 
 
170 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0434  putative transferase  34.18 
 
 
184 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000608739  normal  0.0186988 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03081  hypothetical protein  34.18 
 
 
184 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000850407  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4038  carbonic anhydrase  38.52 
 
 
180 aa  85.1  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.820028  normal  0.253195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>