38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0158 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0158  ferredoxin protein  100 
 
 		 70 aa  140  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.840482  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4601  ferredoxin protein  93.85 
 
 		 71 aa  122  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3878  ferredoxin protein  73.85 
 
 		 79 aa  103  9e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00422429 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4483  ferredoxin protein  72.88 
 
 		 71 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4371  ferredoxin protein  72.88 
 
 		 73 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.581612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4002  ferredoxin protein  72.88 
 
 		 73 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.314508  normal  0.639017 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8835  hypothetical protein  59.02 
 
 		 83 aa  80.9  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0348262 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1825  hypothetical protein  61.54 
 
 		 81 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0144614 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0399  ferredoxin reductase  49.28 
 
 		 71 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756358 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1947  hypothetical protein  46.67 
 
 		 79 aa  68.6  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1736  ferredoxin reductase  40.98 
 
 		 62 aa  55.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1222  ferredoxin reductase  49.18 
 
 		 63 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69438  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1849  hypothetical protein  40.98 
 
 		 62 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.377437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7491  ferredoxin reductase  37.7 
 
 		 62 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0885689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4583  hypothetical protein  42.62 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4966  hypothetical protein  42.62 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.612536 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4671  hypothetical protein  42.62 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4743  hypothetical protein  38.1 
 
 		 64 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.06168  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5038  hypothetical protein  38.1 
 
 		 64 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4655  hypothetical protein  38.1 
 
 		 64 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0261344  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5162  hypothetical protein  44.26 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.635112 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3842  protein of unknown function DUF1271  39.66 
 
 		 65 aa  47  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0009  hypothetical protein  43.33 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1103  hypothetical protein  34.29 
 
 		 73 aa  46.6  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2499  hypothetical protein  36.51 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3474  hypothetical protein  38.71 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00539266  hitchhiker  0.00542326 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1595  hypothetical protein  40.98 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1636  hypothetical protein  42.86 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228586  normal  0.056801 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4366  hypothetical protein  43.1 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0924062  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3679  hypothetical protein  34.92 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3692  hypothetical protein  34.92 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3752  hypothetical protein  34.92 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10778  ferredoxin  40 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4170  hypothetical protein  37.7 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.71627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1634  hypothetical protein  40.98 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.34193 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2484  hypothetical protein  36.07 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.342972 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4159  hypothetical protein  34.92 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7069  putative ferredoxin  37.5 
 
 		 64 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>