51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1600 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1600  hypothetical protein  100 
 
 
357 aa  718    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.867208  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1412  hypothetical protein  40.51 
 
 
358 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29120  hypothetical protein  43.71 
 
 
361 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00446947 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3985  hypothetical protein  43.87 
 
 
361 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.315148  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1317  hypothetical protein  42.18 
 
 
357 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4572  hypothetical protein  42.18 
 
 
357 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1789  hypothetical protein  41.41 
 
 
364 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.651057  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1582  hypothetical protein  39.47 
 
 
355 aa  273  3e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.422595  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4093  hypothetical protein  42.6 
 
 
357 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3903  hypothetical protein  39.94 
 
 
356 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3872  hypothetical protein  41.09 
 
 
357 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.286953  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03982  hypothetical protein  35.52 
 
 
369 aa  228  9e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.47471  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3749  hypothetical protein  35.17 
 
 
379 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4190  hypothetical protein  32.19 
 
 
395 aa  204  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5355  hypothetical protein  32.84 
 
 
393 aa  193  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2262  hypothetical protein  29.43 
 
 
413 aa  187  3e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.279668  normal  0.10352 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4139  hypothetical protein  27.92 
 
 
376 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12788  hypothetical protein  28.24 
 
 
401 aa  176  4e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.405764  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0375  hypothetical protein  28.21 
 
 
382 aa  166  6.9999999999999995e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0193  hypothetical protein  24.32 
 
 
397 aa  119  7e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0142  hypothetical protein  32.95 
 
 
541 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0125  hypothetical protein  32.39 
 
 
541 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1873  hypothetical protein  23.03 
 
 
385 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146136  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1794  hypothetical protein  23.03 
 
 
385 aa  96.7  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.400536  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2083  hypothetical protein  22.35 
 
 
385 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.213207  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1745  hypothetical protein  20.82 
 
 
384 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.886322  normal  0.285515 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1599  hypothetical protein  27.06 
 
 
1124 aa  63.5  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1111  hypothetical protein  25.35 
 
 
806 aa  54.3  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.685916  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3599  hypothetical protein  23.94 
 
 
960 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42760  hypothetical protein  21.99 
 
 
981 aa  52  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3951  hypothetical protein  27.65 
 
 
1337 aa  50.8  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.595385 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5452  hypothetical protein  22.61 
 
 
1088 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.381107  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62650  hypothetical protein  23.58 
 
 
1088 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0729  hypothetical protein  22.64 
 
 
978 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010551 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2042  protein of unknown function DUF748  23.77 
 
 
1235 aa  48.5  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4569  hypothetical protein  22.17 
 
 
978 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.280096 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1662  hypothetical protein  23.77 
 
 
1235 aa  48.5  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4704  hypothetical protein  22.17 
 
 
978 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.542548  hitchhiker  0.00128014 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3097  protein of unknown function DUF748  24.19 
 
 
1275 aa  46.6  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.331286  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4816  hypothetical protein  23.71 
 
 
983 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.682777  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4703  hypothetical protein  22.17 
 
 
978 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.113752 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1600  hypothetical protein  23.93 
 
 
1073 aa  46.2  0.0009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0485198  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3628  hypothetical protein  25.35 
 
 
1304 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.715566  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2146  hypothetical protein  21.49 
 
 
1169 aa  44.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.848955 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0283  hypothetical protein  24.27 
 
 
1016 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2990  hypothetical protein  23 
 
 
1295 aa  45.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92179  normal  0.306203 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0156  hypothetical protein  22.68 
 
 
950 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.968908  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4173  hypothetical protein  21.15 
 
 
1009 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1356  hypothetical protein  21.2 
 
 
1181 aa  43.9  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4953  hypothetical protein  21.56 
 
 
1281 aa  43.1  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1259  hypothetical protein  21.92 
 
 
996 aa  42.7  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>