51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1235 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1235  carboxylate/amino acid/amine transporter  100 
 
 		 291 aa  578  1e-164  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1920  inner membrane protein  63.86 
 
 		 284 aa  380  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0119644  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001947  putative acetate efflux pump MadN  63.38 
 
 		 292 aa  372  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00531  permease  63.03 
 
 		 292 aa  372  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2439  MadN protein  61.27 
 
 		 295 aa  364  1e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1236  hypothetical protein  64.29 
 
 		 265 aa  350  2e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.294327  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3134  hypothetical protein  53.82 
 
 		 292 aa  330  1e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2726  hypothetical protein  56.49 
 
 		 286 aa  330  2e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.054013  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4075  carboxylate/amino acid/amine transporter  55.82 
 
 		 299 aa  322  4e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126831  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4358  carboxylate/amino acid/amine transporter  55.67 
 
 		 299 aa  316  3e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0263  carboxylate/amino acid/amine transporter  55.79 
 
 		 299 aa  315  7e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3954  carboxylate/amino acid/amine transporter  55.79 
 
 		 299 aa  315  7e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3936  carboxylate/amino acid/amine transporter  53.77 
 
 		 318 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0240  carboxylate/amino acid/amine transporter  55.87 
 
 		 287 aa  311  5.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.214328 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1302  MadN protein  52.92 
 
 		 291 aa  306  3e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01531  putative MadN protein  52.82 
 
 		 287 aa  305  6e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.997992  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3969  carboxylate/amino acid/amine transporter  54.3 
 
 		 299 aa  305  7e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0183  carboxylate/amino acid/amine transporter  52.4 
 
 		 299 aa  295  4e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0261  hypothetical protein  55.31 
 
 		 290 aa  293  2e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1276  hypothetical protein  51.25 
 
 		 288 aa  290  2e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00521241  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0684  hypothetical protein  51.97 
 
 		 287 aa  287  2e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4294  10 TMS Drug/Metabolite Exporter (DME) family  50.52 
 
 		 299 aa  285  9e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4152  carboxylate/amino acid/amine transporter  50.86 
 
 		 299 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4181  carboxylate/amino acid/amine transporter  50.86 
 
 		 299 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0864049 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4051  10 TMS drug/metabolite exporter (DME) family protein  50.86 
 
 		 299 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4349  10 TMS drug/metabolite exporter (DME) family protein  50.86 
 
 		 299 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4194  10 TMS drug/metabolite exporter (DME) family protein  50.86 
 
 		 299 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209407 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03655  hypothetical protein  50.86 
 
 		 299 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03706  predicted inner membrane protein  50.86 
 
 		 299 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1597  hypothetical protein  51.06 
 
 		 292 aa  284  2.0000000000000002e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.483215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0339  hypothetical protein  53.9 
 
 		 292 aa  283  2.0000000000000002e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.252118  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2175  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.24 
 
 		 289 aa  275  7e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000121987  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4083  hypothetical protein  51.26 
 
 		 292 aa  275  8e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.114876  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1433  carboxylate/amino acid/amine transporter  49.46 
 
 		 293 aa  272  6e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.720857  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19150  hypothetical protein  51.57 
 
 		 286 aa  269  4e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.475633 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1301  carboxylate/amino acid/amine transporter  55.19 
 
 		 290 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1652  hypothetical protein  50.87 
 
 		 286 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3822  hypothetical protein  51.62 
 
 		 292 aa  266  4e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047105 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1354  carboxylate/amino acid/amine transporter  49.82 
 
 		 291 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.117278 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4537  carboxylate/amino acid/amine transporter  49.82 
 
 		 291 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.778946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4043  carboxylate/amino acid/amine transporter  47.77 
 
 		 291 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791434 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3830  carboxylate/amino acid/amine transporter  48.42 
 
 		 291 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0974  conserved hypothetical protein, MadN family (DUF6 domain protein)  39.25 
 
 		 292 aa  212  4.9999999999999996e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.634271  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2636  hypothetical protein  35.54 
 
 		 286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1849  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.26 
 
 		 302 aa  142  8e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4998  hypothetical protein  25.64 
 
 		 300 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390809  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2587  hypothetical protein  25 
 
 		 284 aa  46.2  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1754  hypothetical protein  24.68 
 
 		 319 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302164  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  24.69 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2239  membrane protein  27.88 
 
 		 297 aa  43.5  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  27.24 
 
 		 297 aa  43.5  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>