43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0894 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0894  membrane protein-like protein  100 
 
 
125 aa  250  4.0000000000000004e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.952804 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2838  membrane protein-like  37.27 
 
 
122 aa  72  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3132  hypothetical protein  36.04 
 
 
115 aa  71.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754417  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1218  transmembrane protein  33.93 
 
 
118 aa  70.1  0.000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2943  hypothetical protein  40.51 
 
 
124 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3220  putative transmembrane protein  41.77 
 
 
124 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300525  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2873  hypothetical protein  40.51 
 
 
124 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0329049 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2483  transmembrane protein  46.67 
 
 
122 aa  60.1  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.226347 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2984  hypothetical protein  30.43 
 
 
129 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2138  hypothetical protein  29.27 
 
 
128 aa  58.2  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0323108 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2705  hypothetical protein  29.57 
 
 
129 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3127  hypothetical protein  37.37 
 
 
121 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3684  hypothetical protein  29.57 
 
 
129 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2756  hypothetical protein  29.57 
 
 
129 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3715  hypothetical protein  29.57 
 
 
129 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3657  hypothetical protein  29.57 
 
 
129 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1797  hypothetical protein  29.57 
 
 
129 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3248  hypothetical protein  29.57 
 
 
129 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3228  hypothetical protein  35.35 
 
 
121 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.604318  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0361  membrane protein  35 
 
 
130 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0352  membrane protein  35 
 
 
130 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3030  hypothetical protein  35 
 
 
121 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0362  hypothetical protein  28.85 
 
 
125 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3239  hypothetical protein  37.8 
 
 
130 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3102  transmembrane protein  30.19 
 
 
129 aa  51.6  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766019  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0434  membrane protein  36.25 
 
 
130 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.455263  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3532  membrane protein  30.25 
 
 
130 aa  51.2  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22213  normal  0.443182 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2673  membrane protein  36.25 
 
 
130 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.766452  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0413  membrane protein  36.25 
 
 
130 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0113586 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0337  membrane protein  36.76 
 
 
130 aa  50.8  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.173405  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2514  membrane protein-like  26.96 
 
 
126 aa  48.9  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.607723  normal  0.251926 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2750  hypothetical protein  35.9 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4347  hypothetical protein  28.97 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.37521 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3551  hypothetical protein  30.69 
 
 
131 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0392282  hitchhiker  0.000178904 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0407  hypothetical protein  30.85 
 
 
131 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0677  hypothetical protein  29.55 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0963  membrane protein-like protein  25.24 
 
 
122 aa  42.7  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.186902  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4291  hypothetical protein  34.94 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1785  membrane protein-like  28.57 
 
 
128 aa  41.6  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.104689  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0526  membrane protein-like  24.77 
 
 
119 aa  41.6  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000156824  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4348  hypothetical protein  26.5 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.67611  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1100  putative transmembrane protein  23.91 
 
 
149 aa  41.2  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.664506  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1016  hypothetical protein  27.06 
 
 
112 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>