More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3977 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3977  malate dehydrogenase  100 
 
 		 391 aa  767    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3991  malate dehydrogenase  100 
 
 		 391 aa  767    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.122747  normal  0.205066 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4051  malate dehydrogenase  100 
 
 		 391 aa  767    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.812595  normal  0.971942 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4481  malate dehydrogenase  90.88 
 
 		 397 aa  653    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.437151  normal  0.103814 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0588  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  81.44 
 
 		 405 aa  545  1e-154  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2214  malate dehydrogenase  91.43 
 
 		 316 aa  535  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.359473 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30630  malic enzyme  76.64 
 
 		 396 aa  523  1e-147  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.235375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6279  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  72.27 
 
 		 392 aa  503  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.69879  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3994  malate dehydrogenase  67.93 
 
 		 404 aa  468  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4173  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  64.74 
 
 		 416 aa  459  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2900  malate dehydrogenase  63.41 
 
 		 394 aa  455  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0562  malate dehydrogenase (oxaloacetate decarboxylating)  63.64 
 
 		 428 aa  456  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5158  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  62.88 
 
 		 386 aa  454  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.833951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0980  malate dehydrogenase  62.87 
 
 		 464 aa  449  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.428003 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3684  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  63.43 
 
 		 399 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.502842  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3773  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  67.83 
 
 		 399 aa  443  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3685  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  61.83 
 
 		 395 aa  441  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8298  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  62.88 
 
 		 397 aa  429  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.890425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1727  malate dehydrogenase  60.99 
 
 		 396 aa  421  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.993895  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7700  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  64.89 
 
 		 405 aa  416  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474841  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1419  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  63.64 
 
 		 411 aa  414  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3695  malate dehydrogenase  63.96 
 
 		 391 aa  412  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.669073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3751  malate dehydrogenase  62.95 
 
 		 408 aa  411  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.131564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1110  malate dehydrogenase  55.98 
 
 		 481 aa  402  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.421684  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4075  malate dehydrogenase  62.06 
 
 		 391 aa  404  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0926309 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0923  malate dehydrogenase  58.2 
 
 		 477 aa  389  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.663709  normal  0.827819 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2866  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  54.67 
 
 		 489 aa  390  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1376  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  51.19 
 
 		 478 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000390692  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0409  malate dehydrogenase  50.93 
 
 		 383 aa  378  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.192997  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2232  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  51.19 
 
 		 478 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0465  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  56.06 
 
 		 467 aa  379  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0409  malate dehydrogenase  56.66 
 
 		 403 aa  378  1e-104  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0366  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  54.99 
 
 		 468 aa  377  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.697833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1467  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  56.46 
 
 		 470 aa  375  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0113  malate dehydrogenase  55.58 
 
 		 457 aa  375  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.191166  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34210  malic enzyme  56.55 
 
 		 466 aa  372  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2390  malate dehydrogenase (oxaloacetate decarboxylating)  55.53 
 
 		 470 aa  374  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0622  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  54.59 
 
 		 460 aa  374  1e-102  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.295745  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1919  malate oxidoreductase  53.48 
 
 		 387 aa  369  1e-101  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000616521  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1448  malate dehydrogenase  57.78 
 
 		 513 aa  368  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.320703  normal  0.623093 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2490  malate dehydrogenase  51.91 
 
 		 473 aa  371  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.148029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33400  malic enzyme  55.31 
 
 		 473 aa  370  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.513398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08210  malic enzyme  54.11 
 
 		 474 aa  369  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2286  malate dehydrogenase  51.52 
 
 		 474 aa  369  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2803  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  57.22 
 
 		 484 aa  369  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.533173  hitchhiker  0.00320399 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2893  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  52.93 
 
 		 463 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1406  malate dehydrogenase  58.06 
 
 		 490 aa  367  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179901 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1297  malate dehydrogenase  53.57 
 
 		 469 aa  368  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.428219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3211  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  54.7 
 
 		 481 aa  368  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3203  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  52.93 
 
 		 463 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1706  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  57.66 
 
 		 470 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.25266 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3432  malate dehydrogenase  54.7 
 
 		 479 aa  367  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.231586  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20210  malic enzyme  55.8 
 
 		 485 aa  365  1e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2034  malate dehydrogenase  54.4 
 
 		 461 aa  363  2e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184863  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1656  malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  53.8 
 
 		 463 aa  363  4e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.965749  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4565  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  56.33 
 
 		 476 aa  362  4e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.423371  normal  0.479967 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0547  malic enzyme NAD binding subunit  49.21 
 
 		 417 aa  363  4e-99  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.199377  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2141  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  53.01 
 
 		 474 aa  363  4e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0401  malate dehydrogenase  57.27 
 
 		 407 aa  362  7.0000000000000005e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00944416 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0902  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  52.34 
 
 		 411 aa  361  1e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1947  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  56.06 
 
 		 470 aa  361  1e-98  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45330  malate dehydrogenase (oxaloacetate decarboxylating) (NADP+)  48.47 
 
 		 422 aa  361  1e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3045  NAD-dependent malic enzyme  52.45 
 
 		 427 aa  360  2e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.900825  normal  0.491141 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0264  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  56.82 
 
 		 461 aa  360  2e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0169  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  53.87 
 
 		 387 aa  360  2e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0212  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  55.4 
 
 		 500 aa  360  2e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.455099  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1956  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  49.34 
 
 		 390 aa  360  3e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0242  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  54.79 
 
 		 414 aa  360  3e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3884  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  56.16 
 
 		 466 aa  358  8e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1560  NADP-dependent malic enzyme  49.06 
 
 		 415 aa  358  9.999999999999999e-98  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00518562  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1195  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  52.36 
 
 		 463 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.232421 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3983  malate dehydrogenase  53.59 
 
 		 462 aa  357  1.9999999999999998e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0344  malate dehydrogenase  52.11 
 
 		 390 aa  357  2.9999999999999997e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318957  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1265  NADP-dependent malic enzyme, putative  48.1 
 
 		 409 aa  356  3.9999999999999996e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0215  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  51.53 
 
 		 392 aa  354  2e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.984607  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2399  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  49.18 
 
 		 399 aa  354  2e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000325026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0830  malate dehydrogenase  51.09 
 
 		 403 aa  353  2e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.313277  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3355  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  51.88 
 
 		 492 aa  352  4e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240183 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2923  malate dehydrogenase  48.78 
 
 		 414 aa  352  7e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440621  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2458  amino acid-binding ACT  52.5 
 
 		 463 aa  352  7e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3145  malate dehydrogenase  48.78 
 
 		 414 aa  352  7e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.232361  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1765  malate dehydrogenase  48.21 
 
 		 422 aa  352  7e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.188072 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5085  malic enzyme  47.19 
 
 		 422 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.14164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4958  malate dehydrogenase  47.19 
 
 		 425 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0380  malate dehydrogenase  47.19 
 
 		 425 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5135  malate dehydrogenase  47.19 
 
 		 425 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0617  putative malate dehydrogenase  49.59 
 
 		 399 aa  350  2e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4722  putative malate dehydrogenase  49.32 
 
 		 399 aa  350  2e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.93198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0967  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  48.27 
 
 		 407 aa  350  2e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0138  malic protein NAD-binding  50.41 
 
 		 391 aa  350  3e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000809828  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1758  malate dehydrogenase  47.76 
 
 		 409 aa  350  4e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1792  malate dehydrogenase  47.76 
 
 		 409 aa  350  4e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0112  NADP-dependent malic enzyme (NADP-me)  44.3 
 
 		 415 aa  349  4e-95  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0493  malate dehydrogenase  50.68 
 
 		 400 aa  349  4e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0140  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  52.53 
 
 		 503 aa  349  4e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3529  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  54.79 
 
 		 462 aa  349  5e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3134  putative malate dehydrogenase  48.78 
 
 		 414 aa  349  6e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0554  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  53.24 
 
 		 463 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.468225  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0548  malate dehydrogenase  49.32 
 
 		 399 aa  347  2e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0492  malate dehydrogenase (malic enzyme) (NAD-malic enzyme)  49.32 
 
 		 399 aa  347  2e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>