21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1687 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1687  peptidase M15A  100 
 
 
117 aa  245  1e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000498215  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0467  Peptidase M15A  30.77 
 
 
110 aa  69.7  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.383433  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2833  peptidase M15A  33.33 
 
 
132 aa  62.4  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.959813 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1310  peptidase M15A  33.33 
 
 
132 aa  62.4  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.247553  normal  0.128784 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2762  peptidase M15A  33.6 
 
 
130 aa  61.2  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.31642  normal  0.0716961 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1243  peptidase M15A  34.4 
 
 
130 aa  60.8  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.207822 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0248  Peptidase M15A  36.63 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2911  peptidase M15A  34.4 
 
 
133 aa  59.7  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0241  hypothetical protein  30.23 
 
 
129 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2064  peptidase M15A  32 
 
 
132 aa  57.8  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.079322  normal  0.028661 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1882  hypothetical protein  36.28 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000965477  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0939  hypothetical protein  37.17 
 
 
124 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.02091  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3823  peptidase M15A  43.84 
 
 
124 aa  54.3  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0511  peptidase M15A  34.78 
 
 
124 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000425085  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1581  Peptidase M15A  36.63 
 
 
102 aa  51.2  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2254  peptidase M15A  38.81 
 
 
80 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1851  peptidase M15A  30.56 
 
 
224 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0969935  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3631  peptidase M15A  36.36 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.935739  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2108  peptidase M15A  36.36 
 
 
143 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0272473 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1066  hypothetical protein  38.98 
 
 
149 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  29.47 
 
 
341 aa  40.8  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>