35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1292 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_4230  hypothetical protein  47.15 
 
 		 789 aa  642    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.828103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1292  hypothetical protein  100 
 
 		 841 aa  1717    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886595 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2858  hypothetical protein  45.47 
 
 		 835 aa  644    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4253  hypothetical protein  45.52 
 
 		 846 aa  653    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.63096  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2253  subtilisin-like serine protease  42.67 
 
 		 823 aa  634  1e-180  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2676  hypothetical protein  43.89 
 
 		 822 aa  622  1e-177  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.70915 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1693  hypothetical protein  43.18 
 
 		 830 aa  593  1e-168  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.349675  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4275  hypothetical protein  43.94 
 
 		 826 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4804  hypothetical protein  39.29 
 
 		 831 aa  571  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2776  subtilisin-like serine protease  40.56 
 
 		 830 aa  562  1e-158  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.278125  normal  0.827378 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3853  hypothetical protein  41.94 
 
 		 845 aa  547  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1074  hypothetical protein  40.75 
 
 		 825 aa  545  1e-153  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5328  hypothetical protein  38.48 
 
 		 829 aa  538  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355422  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0085  hypothetical protein  41.3 
 
 		 849 aa  533  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0321951  normal  0.899584 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1586  hypothetical protein  36.7 
 
 		 847 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3864  hypothetical protein  36.61 
 
 		 847 aa  501  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000004588 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4893  hypothetical protein  38.8 
 
 		 835 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0387  Y4bN protein  36.77 
 
 		 814 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0549817  normal  0.142123 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2088  hypothetical protein  34.49 
 
 		 847 aa  403  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3535  hypothetical protein  33.56 
 
 		 850 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.692569  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5488  hypothetical protein  32.79 
 
 		 847 aa  364  3e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3670  hypothetical protein  33.62 
 
 		 851 aa  350  6e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.758768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4413  hypothetical protein  47.44 
 
 		 376 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4416  hypothetical protein  37.98 
 
 		 472 aa  273  1e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.710672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0448  hypothetical protein  25.41 
 
 		 712 aa  120  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3504  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.64 
 
 		 827 aa  105  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.227841  normal  0.192563 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3322  S8A family peptidase  26.58 
 
 		 795 aa  97.8  7e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.546962  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2639  hypothetical protein  22.58 
 
 		 821 aa  83.2  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0443804  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1641  Subtilisin-like serine protease protein  25.34 
 
 		 570 aa  65.5  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5977  hypothetical protein  23.87 
 
 		 844 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5574  hypothetical protein  23.87 
 
 		 844 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.218076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2521  hypothetical protein  20.89 
 
 		 869 aa  48.9  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.828375 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1489  hypothetical protein  24.64 
 
 		 858 aa  45.4  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1466  hypothetical protein  24.64 
 
 		 858 aa  45.4  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.467243  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3795  hypothetical protein  25.11 
 
 		 740 aa  44.7  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.542831  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>