44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1037 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1037  DsrE family protein  100 
 
 
271 aa  542  1e-153  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1774  DsrE family protein  95.94 
 
 
271 aa  494  1e-139  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0907  DsrE family protein  95.2 
 
 
271 aa  491  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.386859  normal  0.458991 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0501  DsrE family protein  65.07 
 
 
272 aa  369  1e-101  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1671  DsrE family protein  30.48 
 
 
120 aa  63.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.620887  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02400  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.89 
 
 
831 aa  62.8  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0429  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  24.89 
 
 
820 aa  62  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000601829  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2967  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.33 
 
 
817 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  26.52 
 
 
938 aa  59.3  0.00000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0119  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.72 
 
 
813 aa  56.2  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3470  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.16 
 
 
864 aa  52.8  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2515  rhodanese-like domain-containing protein  28.3 
 
 
354 aa  52.8  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411992  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0035  rhodanese domain-containing protein  28.3 
 
 
354 aa  52.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0035  rhodanese domain-containing protein  28.3 
 
 
354 aa  52.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1830  DsrE family protein  31.43 
 
 
121 aa  52.4  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.169192 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0031  DsrE family protein  30.19 
 
 
121 aa  52.4  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1451  SirA family protein  33.8 
 
 
75 aa  52  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2434  rhodanese-like domain-containing protein  21.58 
 
 
356 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0073  rhodanese domain-containing protein  23.4 
 
 
354 aa  48.9  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0075  rhodanese domain-containing protein  23.4 
 
 
354 aa  48.9  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  32.89 
 
 
80 aa  46.6  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3950  hypothetical protein  27.36 
 
 
111 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.785107  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3847  hypothetical protein  27.36 
 
 
111 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3890  hypothetical protein  27.36 
 
 
111 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3770  hypothetical protein  27.36 
 
 
111 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3780  hypothetical protein  27.36 
 
 
111 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  35.53 
 
 
80 aa  45.8  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  35.53 
 
 
80 aa  45.8  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0205  SirA family protein  31.51 
 
 
81 aa  45.8  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1210  SirA family protein  30.43 
 
 
75 aa  45.8  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0029  redox protein regulator of disulfide bond formation  35.14 
 
 
99 aa  45.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0748983  normal  0.0110056 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4280  SirA-like  28.95 
 
 
83 aa  45.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.277621  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1887  SirA-like protein  24.73 
 
 
195 aa  44.3  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1216  hypothetical protein  28.57 
 
 
120 aa  44.3  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000317596  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1144  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.94 
 
 
817 aa  44.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000586256  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0020  sulfur transfer protein SirA  36.49 
 
 
81 aa  43.9  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000878962 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00453  sulfur transfer protein SirA  34.25 
 
 
82 aa  43.9  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2900  DsrE family protein  40.82 
 
 
129 aa  43.5  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0232  sulfur transfer protein SirA  31.43 
 
 
84 aa  42.7  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3986  sulfur transfer protein SirA  31.43 
 
 
84 aa  42.7  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0570  sulfur transfer protein SirA  31.43 
 
 
84 aa  42.7  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  33.8 
 
 
76 aa  42.7  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1366  SirA family protein  33.33 
 
 
70 aa  42  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0915  hypothetical protein  31.43 
 
 
120 aa  42  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.510132  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>