52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1774 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1774  DsrE family protein  100 
 
 
271 aa  542  1e-153  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1037  DsrE family protein  95.94 
 
 
271 aa  504  9.999999999999999e-143  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0907  DsrE family protein  95.94 
 
 
271 aa  494  1e-139  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.386859  normal  0.458991 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0501  DsrE family protein  63.97 
 
 
272 aa  364  1e-100  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1671  DsrE family protein  30.48 
 
 
120 aa  65.5  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.620887  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02400  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.73 
 
 
831 aa  64.3  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2967  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.24 
 
 
817 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  27.83 
 
 
938 aa  61.6  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0429  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  25.97 
 
 
820 aa  62  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000601829  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0119  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.53 
 
 
813 aa  57  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2434  rhodanese-like domain-containing protein  22.82 
 
 
356 aa  56.6  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2515  rhodanese-like domain-containing protein  28.93 
 
 
354 aa  55.5  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411992  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0035  rhodanese domain-containing protein  28.93 
 
 
354 aa  55.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0035  rhodanese domain-containing protein  28.93 
 
 
354 aa  55.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3470  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25 
 
 
864 aa  54.7  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0031  DsrE family protein  30.19 
 
 
121 aa  53.1  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1830  DsrE family protein  31.43 
 
 
121 aa  52.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.169192 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1451  SirA family protein  33.8 
 
 
75 aa  52.4  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0075  rhodanese domain-containing protein  21.71 
 
 
354 aa  52  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0073  rhodanese domain-containing protein  21.71 
 
 
354 aa  52  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1210  SirA family protein  33.33 
 
 
75 aa  48.9  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  35.53 
 
 
80 aa  46.6  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  35.53 
 
 
80 aa  46.6  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0029  redox protein regulator of disulfide bond formation  35.62 
 
 
99 aa  45.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0748983  normal  0.0110056 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4280  SirA-like  28.95 
 
 
83 aa  45.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.277621  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1144  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.38 
 
 
817 aa  45.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000586256  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3780  hypothetical protein  28 
 
 
111 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3770  hypothetical protein  28 
 
 
111 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3890  hypothetical protein  28 
 
 
111 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3847  hypothetical protein  28 
 
 
111 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3950  hypothetical protein  28 
 
 
111 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.785107  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1216  hypothetical protein  28.57 
 
 
120 aa  44.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000317596  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  36.92 
 
 
75 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0205  SirA family protein  31.51 
 
 
81 aa  44.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0020  sulfur transfer protein SirA  36.49 
 
 
81 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000878962 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  32.89 
 
 
80 aa  44.3  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1812  SirA family protein  28.57 
 
 
79 aa  43.5  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000207986  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1758  SirA family protein  28.57 
 
 
79 aa  43.5  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708198  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2900  DsrE family protein  40.82 
 
 
129 aa  43.1  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00453  sulfur transfer protein SirA  34.25 
 
 
82 aa  43.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  33.78 
 
 
76 aa  43.1  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1959  redox protein regulator of disulfide bond formation-like  27.16 
 
 
103 aa  42.7  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000373287  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4174  SirA family protein  32.81 
 
 
85 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.197617  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  30.14 
 
 
77 aa  42.7  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  36.92 
 
 
75 aa  42.7  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0017  sulfur transfer protein SirA  35.14 
 
 
81 aa  42.4  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000196342 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2791  SirA family protein  27.78 
 
 
76 aa  42.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  33.8 
 
 
76 aa  42.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0017  sulfur transfer protein SirA  34.25 
 
 
81 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000123371 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0017  sulfur transfer protein SirA  34.25 
 
 
81 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  36.92 
 
 
75 aa  42  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0018  sulfur transfer protein SirA  34.25 
 
 
81 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>