27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1462 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1462  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  500  1e-140  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0737  hypothetical protein  91.84 
 
 
245 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.542586  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1218  hypothetical protein  90.2 
 
 
245 aa  457  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.982623 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1592  hypothetical protein  45.53 
 
 
246 aa  221  7e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.961862  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1083  hypothetical protein  45.53 
 
 
246 aa  219  3e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0863  hypothetical protein  44.68 
 
 
246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.581089  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2030  hypothetical protein  42.67 
 
 
248 aa  204  1e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2165  hypothetical protein  42.02 
 
 
247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1460  hypothetical protein  39.83 
 
 
247 aa  196  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0386227  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0707  hypothetical protein  37.45 
 
 
247 aa  194  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3261  hypothetical protein  41.13 
 
 
247 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2469  hypothetical protein  39.58 
 
 
252 aa  186  4e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317526  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0725  Ion transport 2 domain-containing protein  44.92 
 
 
273 aa  185  5e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0347274 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0043  hypothetical protein  41.15 
 
 
245 aa  176  4e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.539415 
 
 
-
 
NC_002936  DET0021  hypothetical protein  38.26 
 
 
250 aa  174  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.195832  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2371  hypothetical protein  37.9 
 
 
252 aa  172  5e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_20  hypothetical protein  37.39 
 
 
434 aa  171  9e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00632625  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1616  hypothetical protein  38.17 
 
 
250 aa  166  4e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00659965  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0700  Ion transport 2 domain protein  41.49 
 
 
274 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00257952  normal  0.062566 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1362  hypothetical protein  38.17 
 
 
250 aa  163  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00740931  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0020  hypothetical protein  38.81 
 
 
250 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0643  hypothetical protein  35.74 
 
 
248 aa  161  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0788162  normal  0.017313 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0870  hypothetical protein  35.14 
 
 
249 aa  160  2e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00543132  normal  0.0127443 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0566  hypothetical protein  34.05 
 
 
246 aa  160  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00270463  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1577  hypothetical protein  38.91 
 
 
257 aa  158  9e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0206  hypothetical protein  34.96 
 
 
251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2531  hypothetical protein  38.46 
 
 
276 aa  136  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>