More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2873 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2873  cold-shock DNA-binding protein family protein  100 
 
 
70 aa  140  6e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3156  cold shock protein  80.6 
 
 
71 aa  114  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3003  cold-shock DNA-binding domain protein  79.1 
 
 
71 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.667413 
 
 
-
 
NC_004310  BR1514  cold-shock family protein  78.79 
 
 
71 aa  111  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1464  cold-shock family protein  77.61 
 
 
83 aa  111  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2743  cold-shock DNA-binding domain protein  79.1 
 
 
71 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2135  cold-shock DNA-binding protein family protein  78.79 
 
 
70 aa  110  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24851  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1650  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  77.27 
 
 
71 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2238  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  77.27 
 
 
71 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611476  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1620  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  74.24 
 
 
70 aa  103  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.246445 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2134  cold-shock DNA-binding protein family protein  74.63 
 
 
70 aa  102  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.895111  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2208  cold-shock DNA-binding domain protein  70.77 
 
 
70 aa  98.6  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2503  cold-shock DNA-binding domain protein  70.77 
 
 
70 aa  98.6  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.731962 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1730  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.67 
 
 
71 aa  97.8  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.244991 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5567  cold shock protein  68.18 
 
 
70 aa  95.9  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.197261  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3148  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.18 
 
 
71 aa  96.3  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0858327  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1364  cold-shock DNA-binding domain protein  62.69 
 
 
71 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.185476  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1179  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.76 
 
 
70 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.810409  normal  0.131975 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0899  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.18 
 
 
70 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1283  cold-shock DNA-binding domain protein  62.69 
 
 
70 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.165738 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0662  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.08 
 
 
70 aa  95.9  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.662229 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5022  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.77 
 
 
69 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.499823  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4315  cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 
69 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0374104  normal  0.166197 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3947  cold-shock protein DNA-binding  65.67 
 
 
69 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.246482 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4677  cold-shock DNA-binding domain protein  62.32 
 
 
69 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.403947  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4422  cold-shock DNA-binding domain protein  64.18 
 
 
69 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.369024 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2980  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.22 
 
 
73 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0073832  normal  0.0936276 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4533  cold-shock DNA-binding domain protein  60.87 
 
 
69 aa  89  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4164  cold-shock protein DNA-binding  60.87 
 
 
69 aa  89  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.593748  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5491  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.42 
 
 
69 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599855  normal  0.0633447 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3436  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.12 
 
 
69 aa  89  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6033  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60.87 
 
 
69 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.263263  normal  0.0669471 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0841  cold-shock DNA-binding domain protein  63.77 
 
 
69 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1345  cold-shock DNA-binding domain protein  57.97 
 
 
69 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.708004 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1185  cold-shock protein DNA-binding  57.97 
 
 
69 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0202677 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6274  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  55.22 
 
 
69 aa  87  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.517051  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1892  cold-shock protein DNA-binding  59.42 
 
 
69 aa  87  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3098  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  57.97 
 
 
69 aa  85.9  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.392301 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1810  cold-shock DNA-binding domain protein  57.97 
 
 
69 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275955  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1676  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60.87 
 
 
69 aa  85.5  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00586625  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3878  cold-shock DNA-binding domain protein  62.86 
 
 
69 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0954  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  57.35 
 
 
68 aa  85.1  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.631034  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_004310  BR1492  cold-shock family protein  60.87 
 
 
69 aa  85.5  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.136425  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3214  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.18 
 
 
68 aa  85.1  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.265865  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4644  cold-shock DNA-binding protein family protein  59.7 
 
 
68 aa  84.7  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1446  cold-shock family protein  68.42 
 
 
105 aa  84.3  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.215876  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3705  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  57.97 
 
 
70 aa  84.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.59949  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4194  cold-shock DNA-binding domain protein  56.52 
 
 
70 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.69443  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1791  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  56.52 
 
 
70 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.29852 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4283  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.7 
 
 
68 aa  84  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3513  cold-shock DNA-binding domain protein  56.52 
 
 
70 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2005  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.7 
 
 
69 aa  84  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.745199  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7022  cold-shock DNA-binding protein family protein  56.52 
 
 
70 aa  84  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0599246  normal  0.604228 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2750  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.43 
 
 
69 aa  83.6  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.33157  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2559  cold-shock DNA-binding domain protein  65.52 
 
 
67 aa  83.2  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0164583 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3209  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.64 
 
 
67 aa  83.2  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.522557 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2375  cold-shock protein, DNA-binding  60 
 
 
69 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.583398  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0886  cold-shock protein DNA-binding  58.21 
 
 
69 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0757124 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0386  cold-shock DNA-binding protein family protein  60.29 
 
 
68 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.654168  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2040  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60.29 
 
 
68 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0850  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60.29 
 
 
68 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1893  cold-shock protein DNA-binding  57.97 
 
 
69 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0846  cold-shock DNA-binding domain protein  58.21 
 
 
69 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.012505 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0009  cold-shock DNA-binding domain protein  59.42 
 
 
68 aa  82.4  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2176  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60.87 
 
 
69 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.141033  normal  0.0176419 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3625  cold-shock DNA-binding protein family protein  58.21 
 
 
68 aa  82.4  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.164813  normal  0.0835288 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3257  cold-shock protein, DNA-binding  60.87 
 
 
69 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0261895 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0810  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 
69 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.509144  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0812  cold-shock DNA-binding domain protein  56.72 
 
 
69 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.674883  normal  0.12074 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5339  cold-shock DNA-binding protein family protein  57.35 
 
 
71 aa  82  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1185  cold-shock DNA-binding protein family protein  56.72 
 
 
69 aa  82  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5378  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  52.17 
 
 
69 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.260469 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0093  cold-shock DNA-binding domain protein  55.07 
 
 
69 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.941798  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3723  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  55.88 
 
 
179 aa  82  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0003  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60.71 
 
 
67 aa  81.6  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0977  cold-shock DNA-binding family protein  63.16 
 
 
69 aa  81.3  0.000000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.717834  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0507  cold-shock DNA-binding domain protein  58.46 
 
 
67 aa  81.3  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.804223  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4458  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  53.62 
 
 
69 aa  81.6  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1914  cold-shock DNA-binding protein family protein  52.17 
 
 
68 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2219  putative cold-shock DNA-binding domain protein  56.52 
 
 
68 aa  81.3  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2681  cold-shock DNA-binding domain protein  56.72 
 
 
68 aa  80.9  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.741556  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5928  cold-shock DNA-binding domain protein  55.07 
 
 
69 aa  80.9  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1521  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.41 
 
 
68 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.490356  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2533  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65 
 
 
69 aa  80.5  0.000000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0311  cold-shock protein, DNA-binding  56.06 
 
 
68 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.656988  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6591  cold-shock DNA-binding domain protein  52.17 
 
 
69 aa  80.1  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426867 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1798  cold-shock DNA-binding domain protein  55.07 
 
 
69 aa  80.1  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0270  cold-shock DNA-binding domain protein  60.71 
 
 
67 aa  79.7  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1056  cold-shock DNA-binding domain protein  55.88 
 
 
70 aa  79.7  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.102694 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1727  cold-shock DNA-binding protein family protein  62.71 
 
 
68 aa  79.7  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5655  cold-shock DNA-binding domain protein  52.17 
 
 
69 aa  80.1  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313891  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2065  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  55.07 
 
 
68 aa  79.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142025 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0769  cold-shock DNA-binding domain protein  54.41 
 
 
69 aa  79.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.218929 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6014  cold-shock DNA-binding protein family protein  62.71 
 
 
67 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6028  cold-shock DNA-binding protein family protein  62.71 
 
 
67 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0078  cold-shock DNA-binding domain protein  53.62 
 
 
69 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.19657  normal  0.176991 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3653  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  56.52 
 
 
80 aa  79  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.820165  normal  0.8886 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0217  cold-shock DNA-binding domain protein  56.52 
 
 
69 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2503  cold-shock DNA-binding protein family protein  52.86 
 
 
68 aa  79.3  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000079429  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0567  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  56.52 
 
 
68 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.0000000000101913  hitchhiker  0.000143899 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>