28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0440 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0440  hypothetical protein  100 
 
 
372 aa  752    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.463768 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1755  cellulose biosynthesis protein CelD  30.85 
 
 
359 aa  166  6.9999999999999995e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189987  normal  0.140777 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1351  hypothetical protein  30.22 
 
 
376 aa  163  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7654  cellulose biosynthesis protein CelD  28.62 
 
 
376 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1928  polysaccharide biosynthesis protein CelD  30.55 
 
 
364 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411311  normal  0.123399 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1683  cellulose biosynthetic (CelD)-like protein  29.09 
 
 
359 aa  153  5e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.548843  normal  0.0452897 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2354  hypothetical protein  30.21 
 
 
381 aa  148  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3587  hypothetical protein  28.8 
 
 
363 aa  145  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3602  polysaccharide biosynthesis protein CelD  28.97 
 
 
363 aa  144  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317396  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0656  hypothetical protein  32.37 
 
 
349 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4871  hypothetical protein  30.4 
 
 
360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7661  polysaccharide biosynthesis protein CelD  29.17 
 
 
363 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1930  polysaccharide biosynthesis protein CelD  29.24 
 
 
360 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0135323  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0664  cellulose biosynthesis protein CelD  27.59 
 
 
326 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.250925 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0307  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  27.74 
 
 
394 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2698  hypothetical protein  35.14 
 
 
400 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.402222  normal  0.567569 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5867  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  28.88 
 
 
434 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325984  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1416  hypothetical protein  30.84 
 
 
395 aa  50.1  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3092  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  30.08 
 
 
397 aa  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0510959  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2462  hypothetical protein  30.17 
 
 
397 aa  49.7  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4604  hypothetical protein  33 
 
 
406 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2662  hypothetical protein  35.9 
 
 
400 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.752873  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3442  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  29.68 
 
 
298 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2685  hypothetical protein  31.33 
 
 
399 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0527922  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6855  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  26.9 
 
 
354 aa  43.9  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5588  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  33.33 
 
 
379 aa  43.5  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236131  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2433  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  30.43 
 
 
407 aa  43.1  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4259  hypothetical protein  32.93 
 
 
337 aa  43.5  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.164771 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>