25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3088 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3029  hypothetical protein  100 
 
 
597 aa  1109    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3088  hypothetical protein  100 
 
 
597 aa  1109    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0939277  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3045  hypothetical protein  98.16 
 
 
593 aa  767    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185141  normal  0.289223 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3578  hypothetical protein  62.13 
 
 
604 aa  528  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214461  normal  0.0454091 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2837  hypothetical protein  66.67 
 
 
614 aa  523  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4305  membrane protein-like protein  38.25 
 
 
679 aa  270  8e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.345935  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0888  hypothetical protein  37.62 
 
 
601 aa  155  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7071  hypothetical protein  42.58 
 
 
639 aa  101  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0606  hypothetical protein  25 
 
 
573 aa  54.7  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000211502  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0746  hypothetical protein  20.89 
 
 
573 aa  53.9  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000103771 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0657  hypothetical protein  20.73 
 
 
573 aa  53.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0416794  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0691  hypothetical protein  20.73 
 
 
573 aa  53.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00673286  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0819  hypothetical protein  21.87 
 
 
573 aa  52  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000546296  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4612  hypothetical protein  22.87 
 
 
573 aa  50.8  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000184306  normal  0.241609 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0760  hypothetical protein  23.38 
 
 
573 aa  50.4  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00101969  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0723  hypothetical protein  22.43 
 
 
573 aa  50.4  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00206833  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0601  hypothetical protein  20.1 
 
 
573 aa  50.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000191529  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0786  hypothetical protein  27.47 
 
 
938 aa  50.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.447385 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1508  hypothetical protein  27.72 
 
 
949 aa  47.8  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.144952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0602  hypothetical protein  20.49 
 
 
573 aa  47.4  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.139247  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3548  Apolipoprotein A1/A4/E  37.84 
 
 
2327 aa  45.1  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.808301 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0802  hypothetical protein  27.57 
 
 
957 aa  45.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.627232 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1751  putative integral membrane protein  27.42 
 
 
954 aa  44.7  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1640  putative integral membrane protein  27.42 
 
 
954 aa  44.7  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1901  membrane protein-like protein  43.48 
 
 
1146 aa  43.5  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.95592  normal  0.876478 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>