29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2572 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2527  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  427  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2572  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  427  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2564  hypothetical protein  99.52 
 
 
209 aa  425  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4745  hypothetical protein  67.8 
 
 
206 aa  296  1e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1969  hypothetical protein  67.82 
 
 
207 aa  263  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.256176  normal  0.256404 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4331  manganese transport protein  67.68 
 
 
201 aa  256  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0417  NADPH-dependent FMN reductase  53.23 
 
 
205 aa  212  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7142  hypothetical protein  51.49 
 
 
205 aa  201  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5993  hypothetical protein  50.5 
 
 
205 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4291  hypothetical protein  51.74 
 
 
210 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3624  hypothetical protein  59.2 
 
 
205 aa  176  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4864  hypothetical protein  49.7 
 
 
201 aa  170  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0588631  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2077  BRAMP  40.2 
 
 
216 aa  144  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00766184  normal  0.590504 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0810  BRAMP  37.44 
 
 
233 aa  136  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.22904  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2691  hypothetical protein  37.19 
 
 
234 aa  125  5e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10403  hypothetical protein  36.02 
 
 
236 aa  121  8e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1423  hypothetical protein  36.68 
 
 
248 aa  119  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2466  hypothetical protein  33.02 
 
 
243 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00315756  hitchhiker  0.00463895 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10943  hypothetical protein  33.18 
 
 
245 aa  105  7e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1830  Multimeric flavodoxin WrbA-like protein  36.11 
 
 
192 aa  102  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00348996  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2720  hypothetical protein  32.41 
 
 
240 aa  100  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00344324 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3009  hypothetical protein  31.8 
 
 
249 aa  99  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  25.5 
 
 
221 aa  43.1  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5282  FMN reductase, NADPH-dependent  21.9 
 
 
181 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1623  hypothetical protein  22.16 
 
 
194 aa  42.4  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  22.67 
 
 
191 aa  42  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  23.9 
 
 
205 aa  42.4  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2017  hypothetical protein  19.81 
 
 
236 aa  41.6  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.499151  normal  0.173884 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1845  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  25.25 
 
 
152 aa  41.2  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>