23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3407 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3407  hypothetical protein  100 
 
 
438 aa  885    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.846778 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3396  hypothetical protein  99.67 
 
 
300 aa  620  1e-176  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3459  hypothetical protein  99.67 
 
 
300 aa  620  1e-176  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.972457  normal  0.141777 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11772  hypothetical protein  49.57 
 
 
503 aa  331  2e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00013722  hitchhiker  0.00000000159195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0411  hypothetical protein  44.27 
 
 
701 aa  285  9e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0420  hypothetical protein  44.27 
 
 
701 aa  285  9e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0399  hypothetical protein  44.27 
 
 
701 aa  285  9e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.708944  normal  0.4218 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4575  hypothetical protein  45.43 
 
 
429 aa  276  5e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5180  hypothetical protein  41.73 
 
 
692 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.357825 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1576  hypothetical protein  40.65 
 
 
676 aa  241  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.592889  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2701  hypothetical protein  37.83 
 
 
680 aa  236  9e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2671  hypothetical protein  37.83 
 
 
676 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0971052  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2716  hypothetical protein  37.83 
 
 
676 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.138659  normal  0.0803009 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1631  carbohydrate-binding protein  40.12 
 
 
606 aa  225  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277335  normal  0.43488 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4414  carbohydrate-binding protein  40.92 
 
 
357 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119276  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32500  hypothetical protein  35.67 
 
 
328 aa  192  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2002  hypothetical protein  33.62 
 
 
502 aa  174  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1707  carbohydrate-binding protein  32.11 
 
 
386 aa  120  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2501  hypothetical protein  29.16 
 
 
371 aa  83.6  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.942803  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2970  hypothetical protein  28.45 
 
 
370 aa  62.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.751767  normal  0.167477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5522  hypothetical protein  23.5 
 
 
371 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.853914 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2125  hypothetical protein  26.21 
 
 
320 aa  45.8  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1433  hypothetical protein  27.72 
 
 
350 aa  44.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>