24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_R0016 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_R0016  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0206825  normal  0.182521 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0035  tRNA-Glu  96.3 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0052  tRNA-Glu  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.914226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0011  tRNA-Glu  97.87 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.638605 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0052  tRNA-Glu  95.74 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0017  tRNA-Glu  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0012  tRNA-Glu  93.18 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0027  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.024041 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0033  tRNA-Asp  90.48 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0012  tRNA-Asp  90.48 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.326071  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0010  tRNA-Asp  90.48 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.330224  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0039  tRNA-Asp  90.48 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.914328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0037  tRNA-Asp  90.48 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0040  tRNA-Asp  90.48 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0037  tRNA-Asp  90.48 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0035  tRNA-Asp  90.48 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0024  tRNA-Asp  90.48 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0232255  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0022  tRNA-Asp  90.48 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0421287  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0014  tRNA-Gln  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0017  tRNA-Glu  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0063  tRNA-Glu  88.64 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0632745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0013  tRNA-Gln  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0422006 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0015  tRNA-Gln  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.616091  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0038  tRNA-Gln  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0250632  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>