12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_R0013 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_R0013  tRNA-Gln  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0422006 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0038  tRNA-Gln  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0250632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0015  tRNA-Gln  93.44 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.616091  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0010  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.78413 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0012  tRNA-Gln  87.72 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000171434  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0001  tRNA-Gln  87.72 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.753246 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0014  tRNA-Gln  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0003  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.270381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0056  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0607311  normal  0.474251 
 
 
-
 
NC_013926  ABOO_t70  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 121 bp  48.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0037  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.21352e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0016  tRNA-Glu  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0206825  normal  0.182521 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>