63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5199 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_5199  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  100 
 
 
471 aa  946    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1138  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  84.32 
 
 
442 aa  720    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1606  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  49.65 
 
 
476 aa  341  1e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.77483  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1096  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  35.8 
 
 
467 aa  209  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3229  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  33.55 
 
 
482 aa  179  7e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3014  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  33.55 
 
 
482 aa  179  7e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1868  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  33.55 
 
 
482 aa  179  7e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0224  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  33.55 
 
 
482 aa  179  7e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4625  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  30.63 
 
 
464 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0009  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  31.42 
 
 
472 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1826  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  47.14 
 
 
233 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6615  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  34.38 
 
 
561 aa  100  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1544  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  32.16 
 
 
390 aa  97.1  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.170767 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1546  ORF-3 family protein  34.72 
 
 
205 aa  97.1  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0403553 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1350  hypothetical protein  30 
 
 
188 aa  93.2  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0718153  normal  0.422526 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1348  hypothetical protein  32.52 
 
 
189 aa  92.8  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.244032  normal  0.420719 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3347  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  31.25 
 
 
236 aa  92  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3209  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  31.25 
 
 
236 aa  92.4  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000122349  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3702  hypothetical protein  31.96 
 
 
200 aa  90.9  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4396  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  31.96 
 
 
200 aa  90.9  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0736  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  31.43 
 
 
200 aa  89.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2989  plasmid pRiA4b ORF-3-like  27.4 
 
 
198 aa  87.8  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.176424  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2928  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  30.52 
 
 
197 aa  87  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3350  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  35.44 
 
 
205 aa  86.3  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.579719 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0351  hypothetical protein  29.05 
 
 
200 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3157  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  33.54 
 
 
205 aa  85.1  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.660843  normal  0.490567 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1473  hypothetical protein  35.03 
 
 
224 aa  84.3  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0966536  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3332  hypothetical protein  35.03 
 
 
219 aa  84.3  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7311  hypothetical protein  35.03 
 
 
219 aa  84.3  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7408  hypothetical protein  35.03 
 
 
219 aa  84.3  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7710  hypothetical protein  35.03 
 
 
219 aa  84.3  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0533799 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0270  hypothetical protein  35.03 
 
 
219 aa  84.3  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7639  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  31.25 
 
 
198 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.836556 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1501  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  34.52 
 
 
181 aa  84  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124418  hitchhiker  0.00011346 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1556  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  33.93 
 
 
181 aa  83.2  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.568333 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4604  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  37.35 
 
 
220 aa  82.8  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1895  hypothetical protein  33.55 
 
 
198 aa  82.4  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.138614  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4524  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  29.45 
 
 
192 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  29.91 
 
 
432 aa  79.7  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2027  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  30.71 
 
 
522 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000415443  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1222  hypothetical protein  28.27 
 
 
200 aa  76.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0186  hypothetical protein  28.27 
 
 
200 aa  76.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4882  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  31.85 
 
 
207 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1921  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  30.13 
 
 
196 aa  75.5  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5534  plasmid pRiA4b ORF-3-like  26.55 
 
 
196 aa  75.1  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6856  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  31.75 
 
 
198 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424573  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4606  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  28.43 
 
 
205 aa  73.9  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0299276  normal  0.248208 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04841  hypothetical protein  30.13 
 
 
196 aa  72.8  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0745  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  29.38 
 
 
211 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5433  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  29.66 
 
 
231 aa  71.2  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2884  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  29.23 
 
 
521 aa  70.5  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5189  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  28.47 
 
 
189 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0165882  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2272  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  29.14 
 
 
383 aa  67.8  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4094  hypothetical protein  30.77 
 
 
180 aa  65.9  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3173  hypothetical protein  33.93 
 
 
237 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158168  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3019  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  22.07 
 
 
230 aa  61.2  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4772  hypothetical protein  27.34 
 
 
645 aa  53.9  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021908 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4150  hypothetical protein  28.87 
 
 
221 aa  53.1  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.038459  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2506  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  26.55 
 
 
130 aa  52.4  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0566  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  27.18 
 
 
130 aa  50.4  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6051  hypothetical protein  37.88 
 
 
280 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5922  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  42 
 
 
114 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0548  hypothetical protein  27.43 
 
 
212 aa  45.8  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>