26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3342 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3342  abortive infection protein  100 
 
 
253 aa  481  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0291564 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3070  abortive infection protein  90.12 
 
 
253 aa  409  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.715481  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2821  abortive infection protein  78.15 
 
 
244 aa  368  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200402  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11891  integral membrane protein  73.33 
 
 
256 aa  343  2e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.413388 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2794  abortive infection protein  78.15 
 
 
244 aa  337  8e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2838  abortive infection protein  78.15 
 
 
244 aa  337  8e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3058  Abortive infection protein  64.14 
 
 
255 aa  281  9e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.112534  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2722  Abortive infection protein  47.79 
 
 
250 aa  199  5e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2427  Abortive infection protein  44.28 
 
 
225 aa  131  7.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.856129 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1983  Abortive infection protein  35.53 
 
 
227 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00182843  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5061  Abortive infection protein  38.22 
 
 
247 aa  99.4  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5235  Abortive infection protein  38.98 
 
 
241 aa  94.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1233  hypothetical protein  35.07 
 
 
289 aa  85.5  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000856081 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2306  Abortive infection protein  43.71 
 
 
226 aa  77.8  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.142554  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1632  abortive infection protein  34.86 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0650  abortive infection protein  33.62 
 
 
246 aa  67.4  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.552729  normal  0.37723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4927  abortive infection protein  42.24 
 
 
212 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.374619  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4631  abortive infection protein  42.24 
 
 
212 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4544  abortive infection protein  42.24 
 
 
212 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2204  Abortive infection protein  34.51 
 
 
204 aa  52  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5117  abortive infection protein  34.48 
 
 
223 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0210896  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10819  hypothetical protein  39.17 
 
 
209 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.207156 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2009  abortive infection protein  26.37 
 
 
271 aa  44.7  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0143983  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0549  abortive infection protein  21.35 
 
 
228 aa  42.7  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0265  CAAX amino terminal protease family protein  28.57 
 
 
235 aa  42.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000459802  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0237  CAAX amino protease  28.57 
 
 
253 aa  42  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.4387099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>