17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1853 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1853  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  284  2.9999999999999996e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2218  hypothetical protein  70 
 
 
140 aa  183  6e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3028  hypothetical protein  62.02 
 
 
146 aa  145  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0868  hypothetical protein  55 
 
 
205 aa  144  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0799  hypothetical protein  51.94 
 
 
211 aa  138  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2674  hypothetical protein  56.52 
 
 
201 aa  137  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.681359  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0763  hypothetical protein  48.87 
 
 
210 aa  127  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2452  hypothetical protein  49.17 
 
 
230 aa  122  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.289718  normal  0.470045 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2830  hypothetical protein  46.27 
 
 
142 aa  122  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0594  hypothetical protein  38.93 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.40048e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1190  hypothetical protein  35.51 
 
 
131 aa  50.4  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0357  putative lipoprotein  33.55 
 
 
219 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000581024  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3130  putative lipoprotein  32.52 
 
 
220 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1808  putative lipoprotein  26.67 
 
 
220 aa  47.8  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000291865  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4040  hypothetical protein  26.32 
 
 
126 aa  45.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.344476  normal  0.247596 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3871  lipoprotein, putative  27.05 
 
 
225 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.873664 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0271  putative lipoprotein  30 
 
 
220 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>