18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3028 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3028  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  287  3e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1853  hypothetical protein  62.02 
 
 
138 aa  165  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2218  hypothetical protein  60.5 
 
 
140 aa  159  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0799  hypothetical protein  45.14 
 
 
211 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2674  hypothetical protein  51.47 
 
 
201 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.681359  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0868  hypothetical protein  45.45 
 
 
205 aa  127  5.0000000000000004e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0763  hypothetical protein  44.14 
 
 
210 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2452  hypothetical protein  43.7 
 
 
230 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.289718  normal  0.470045 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2830  hypothetical protein  42.4 
 
 
142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0594  hypothetical protein  38.66 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.40048e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4040  hypothetical protein  34.26 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.344476  normal  0.247596 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2386  hypothetical protein  30.08 
 
 
125 aa  47.4  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117772  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0271  putative lipoprotein  31.67 
 
 
220 aa  47.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0357  putative lipoprotein  31.78 
 
 
219 aa  45.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000581024  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1808  putative lipoprotein  27.5 
 
 
220 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000291865  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3871  lipoprotein, putative  33.33 
 
 
225 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.873664 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3787  lipoprotein, putative  32.35 
 
 
226 aa  44.7  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3130  putative lipoprotein  32.23 
 
 
220 aa  45.1  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>