18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0868 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0868  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  413  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0799  hypothetical protein  47.74 
 
 
211 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0763  hypothetical protein  46.86 
 
 
210 aa  162  3e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2452  hypothetical protein  36.36 
 
 
230 aa  156  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.289718  normal  0.470045 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2674  hypothetical protein  46 
 
 
201 aa  156  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.681359  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2218  hypothetical protein  56.67 
 
 
140 aa  148  5e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1853  hypothetical protein  55 
 
 
138 aa  144  9e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0594  hypothetical protein  37.07 
 
 
206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.40048e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2830  hypothetical protein  42.5 
 
 
142 aa  122  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3028  hypothetical protein  45.8 
 
 
146 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0357  putative lipoprotein  30.23 
 
 
219 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000581024  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1808  putative lipoprotein  27.85 
 
 
220 aa  70.1  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000291865  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3130  putative lipoprotein  28.24 
 
 
220 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0271  putative lipoprotein  26.48 
 
 
220 aa  62.4  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3871  lipoprotein, putative  25.91 
 
 
225 aa  59.7  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.873664 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3787  lipoprotein, putative  24.07 
 
 
226 aa  52.4  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1854  hypothetical protein  52.63 
 
 
61 aa  52  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2219  hypothetical protein  53.33 
 
 
74 aa  43.1  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>