16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2674 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2674  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  399  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.681359  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0763  hypothetical protein  57.69 
 
 		 210 aa  217  1e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0799  hypothetical protein  49.74 
 
 		 211 aa  181  6e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0868  hypothetical protein  50.27 
 
 		 205 aa  175  4e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2452  hypothetical protein  40.83 
 
 		 230 aa  157  7e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.289718  normal  0.470045 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2218  hypothetical protein  56.41 
 
 		 140 aa  141  7e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1853  hypothetical protein  56.52 
 
 		 138 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2830  hypothetical protein  47.83 
 
 		 142 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0594  hypothetical protein  37.79 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.40048e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3028  hypothetical protein  51.47 
 
 		 146 aa  117  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0357  putative lipoprotein  31.51 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000581024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1808  putative lipoprotein  27.27 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000291865  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0271  putative lipoprotein  28.57 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3130  putative lipoprotein  31.1 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3871  lipoprotein, putative  26.64 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.873664 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3787  lipoprotein, putative  24.89 
 
 		 226 aa  45.1  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>