13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3871 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3871  lipoprotein, putative  100 
 
 		 225 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.873664 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3787  lipoprotein, putative  88.94 
 
 		 226 aa  368  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1808  putative lipoprotein  58.85 
 
 		 220 aa  250  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000291865  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3130  putative lipoprotein  59.03 
 
 		 220 aa  246  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0357  putative lipoprotein  56.83 
 
 		 219 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000581024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0271  putative lipoprotein  42.42 
 
 		 220 aa  156  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0799  hypothetical protein  31.62 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0594  hypothetical protein  25.55 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.40048e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0868  hypothetical protein  26.32 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2218  hypothetical protein  28.33 
 
 		 140 aa  52.8  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0763  hypothetical protein  26.2 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2452  hypothetical protein  27.46 
 
 		 230 aa  48.5  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.289718  normal  0.470045 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1853  hypothetical protein  27.05 
 
 		 138 aa  45.4  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>