21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0310 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0310  putative signal peptide protein  100 
 
 
159 aa  327  3e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0170158  normal  0.139977 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3446  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.7 
 
 
157 aa  124  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0721  cupin 2, barrel  41.25 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0322  cupin 2 domain-containing protein  37.25 
 
 
159 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3547  cupin region  45.53 
 
 
156 aa  108  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0815516  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0272  cupin region  39.62 
 
 
156 aa  107  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0932  cupin 2 conserved barrel domain protein  38.16 
 
 
162 aa  100  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0167098 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3937  cupin region  41.79 
 
 
167 aa  98.2  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.674346  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3035  putative signal peptide protein  41.54 
 
 
163 aa  97.8  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3382  conserved hypothetical signal peptide protein  41.54 
 
 
163 aa  97.4  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3099  putative signal peptide protein  41.32 
 
 
162 aa  95.1  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0562  cupin 2, barrel  34.4 
 
 
162 aa  94  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.988265  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0092  hypothetical protein  31.5 
 
 
142 aa  80.5  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1520  cupin region  35.83 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.181654  normal  0.367845 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0147  hypothetical protein  32.41 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.820843 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2856  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.47 
 
 
157 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.346504  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1170  hypothetical protein  31.62 
 
 
161 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2078  hypothetical protein  30.67 
 
 
158 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.936672 
 
 
-
 
NC_003296  RS02079  signal peptide protein  29.09 
 
 
163 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05330  hypothetical protein  33.02 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1663  cupin 2, barrel  26.24 
 
 
159 aa  44.3  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>