More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4146 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4628  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  96.79 
 
 		 343 aa  653    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0600434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4514  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  99.71 
 
 		 343 aa  672    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0165185  normal  0.948417 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4146  ATPase  100 
 
 		 343 aa  674    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.661035 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4206  ATPase  85.33 
 
 		 334 aa  543  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0979498  normal  0.146626 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8036  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  79.01 
 
 		 343 aa  530  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0475  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  69.07 
 
 		 345 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1911  ATPase  66.97 
 
 		 356 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1525  moxR protein, putative  63.96 
 
 		 342 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0519563  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2040  ATPase  59.16 
 
 		 339 aa  426  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0687  ATPase  58.04 
 
 		 343 aa  418  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.139478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4033  ATPase  59.94 
 
 		 339 aa  421  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112825  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1895  ATPase  58.04 
 
 		 338 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.59943 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3278  MoxR protein, putative  59.46 
 
 		 339 aa  414  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.970658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1896  MoxR protein, putative  56.68 
 
 		 340 aa  409  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.155762 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2997  ATPase  61.06 
 
 		 339 aa  409  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0140199  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0783  moxR protein  58.63 
 
 		 339 aa  402  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.587731  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3047  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  58.26 
 
 		 339 aa  404  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1825  ATPase  58.75 
 
 		 339 aa  398  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.953694 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2421  putative MxaR-like protein  56.29 
 
 		 339 aa  391  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.868605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3801  ATPase  57.4 
 
 		 339 aa  386  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1201  ATPase  35.41 
 
 		 325 aa  160  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3171  magnesium chelatase, ChlI subunit; methanol dehydrogenase regulator  32.83 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000309  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  31.19 
 
 		 327 aa  156  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1408  AAA family ATPase  35.99 
 
 		 336 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174801  decreased coverage  0.00669065 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  31.93 
 
 		 327 aa  153  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13723  methanol dehydrogenase transcriptional regulatory protein moxR2  34.93 
 
 		 358 aa  153  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.861123  normal  0.434695 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3028  ATPase  33.64 
 
 		 370 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4318  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.52 
 
 		 317 aa  152  8e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.86 
 
 		 319 aa  151  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  30.63 
 
 		 328 aa  151  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2942  MoxR-like ATPase  32.93 
 
 		 309 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000701608  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1832  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.14 
 
 		 327 aa  151  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0761844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2135  MoxR-like ATPase, putative transcriptional regulator, C1 metabolism  33.33 
 
 		 319 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.783557  decreased coverage  0.00358329 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  32.41 
 
 		 337 aa  150  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2493  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.23 
 
 		 378 aa  149  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1747  MoxR-like ATPase  33.66 
 
 		 321 aa  150  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1942  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  35.86 
 
 		 322 aa  149  5e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0849  ATPase  35.79 
 
 		 324 aa  149  6e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0895498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1752  ATPase  34.69 
 
 		 303 aa  149  6e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.682382  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2988  hypothetical protein  32.23 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  31.71 
 
 		 327 aa  149  1.0000000000000001e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3159  hypothetical protein  32.59 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.317083  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2500  ATPase  33.71 
 
 		 327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352977  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2447  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.51 
 
 		 331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000279611 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0095  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.46 
 
 		 342 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2812  MoxR-like ATPase  32.43 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1945  ATPase  34.12 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3254  ATPase  32.63 
 
 		 371 aa  147  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2379  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  36.94 
 
 		 336 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000313981  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1386  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  34.97 
 
 		 369 aa  146  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00566966  hitchhiker  0.00712673 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02348  methanol dehydrogenase regulatory protein  35.17 
 
 		 339 aa  146  5e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1314  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.09 
 
 		 350 aa  146  5e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.239316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5501  ATPase  34.37 
 
 		 334 aa  146  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0337112  normal  0.121576 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3320  ATPase  33.13 
 
 		 347 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3749  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.33 
 
 		 327 aa  145  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.234316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4478  ATPase  30.97 
 
 		 337 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3035  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.25 
 
 		 354 aa  145  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0745006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2716  ATPase  34.22 
 
 		 342 aa  145  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0331951  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  31.5 
 
 		 332 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02702  putative ATPase family protein  33.33 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.503742  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4903  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.72 
 
 		 344 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512552  normal  0.346219 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2398  ATPase  32.12 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5141  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.04 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2912  ATPase  34.02 
 
 		 331 aa  144  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0275816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11508  transcriptional regulatory protein moxR1  33.13 
 
 		 377 aa  144  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.269951  normal  0.0724803 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1369  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.13 
 
 		 306 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1399  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.13 
 
 		 306 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0788  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.73 
 
 		 331 aa  144  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.68175  normal  0.0266567 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2344  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.33 
 
 		 332 aa  144  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3112  ATPase  34.62 
 
 		 331 aa  144  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0862  ATPase  31.72 
 
 		 330 aa  143  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0166086  normal  0.0307461 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1845  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.18 
 
 		 326 aa  143  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2771  hypothetical protein  31.01 
 
 		 331 aa  143  4e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0821  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.72 
 
 		 330 aa  143  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.297933 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2917  hypothetical protein  30.7 
 
 		 331 aa  143  5e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20690  MoxR-like ATPase  32.45 
 
 		 340 aa  143  5e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.138823  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.84 
 
 		 341 aa  143  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000363093  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3201  ATPase  31.02 
 
 		 319 aa  143  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3015  hypothetical protein  30.49 
 
 		 309 aa  142  6e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.82 
 
 		 331 aa  142  6e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3034  ATPase, AAA family  29.88 
 
 		 310 aa  142  6e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3389  ATPase  33.55 
 
 		 333 aa  142  6e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428548 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1135  ATPase  35.69 
 
 		 369 aa  142  6e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.100674  hitchhiker  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3068  ATPase, AAA family  28.48 
 
 		 310 aa  142  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0718148  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3113  putative MoxR-like ATPase  33.03 
 
 		 321 aa  142  7e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.70365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0564  ATPase  33.55 
 
 		 333 aa  142  8e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2741  hypothetical protein  31.9 
 
 		 347 aa  142  9e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2427  ATPase  31.78 
 
 		 318 aa  142  9e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344662 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1954  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.67 
 
 		 353 aa  142  9e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.25859  hitchhiker  0.000487969 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4443  ATPase  32.42 
 
 		 333 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.259464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0095  ATPase  30.06 
 
 		 329 aa  142  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.204442  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09300  MoxR-like ATPase  33.92 
 
 		 353 aa  142  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.293908 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.76 
 
 		 325 aa  142  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2070  hypothetical protein  32.91 
 
 		 326 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2227  hypothetical protein  30.18 
 
 		 309 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.837362  hitchhiker  0.00000000223173 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1054  ATPase  28.88 
 
 		 318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3891  ATPase  30.77 
 
 		 344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4860  ATPase  33.43 
 
 		 329 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4949  ATPase  33.43 
 
 		 329 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5228  ATPase  33.43 
 
 		 329 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537917  normal  0.162755 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>