28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2581 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2581  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  268  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2804  protein of unknown function DUF1236  100 
 
 		 137 aa  268  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.581612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2609  protein of unknown function DUF1236  99.27 
 
 		 137 aa  266  7e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.330788  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5927  protein of unknown function DUF1236  75.36 
 
 		 137 aa  151  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5270  hypothetical protein  73.91 
 
 		 137 aa  148  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.100526  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0457  hypothetical protein  68.84 
 
 		 138 aa  135  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.810784 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4429  hypothetical protein  69.57 
 
 		 138 aa  135  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1032  hypothetical protein  79.52 
 
 		 137 aa  133  9e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0259413 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1280  hypothetical protein  73.77 
 
 		 139 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0200201  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1184  hypothetical protein  48.18 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0429194 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1342  protein of unknown function DUF1236  47.45 
 
 		 137 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1616  hypothetical protein  52 
 
 		 148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.735089  hitchhiker  0.000199985 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0234  hypothetical protein  57.25 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.301588  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0372  hypothetical protein  54.96 
 
 		 138 aa  103  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0136  hypothetical protein  51.91 
 
 		 139 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1806  protein of unknown function DUF1236  55.07 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0713  hypothetical protein  56.03 
 
 		 139 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0569  protein of unknown function DUF1236  53.45 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2358  hypothetical protein  40.58 
 
 		 115 aa  73.9  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.318896  normal  0.1272 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0154  protein of unknown function DUF1236  48.59 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.285962 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4345  hypothetical protein  36.8 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0703177 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3209  hypothetical protein  44.59 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.542631  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2585  hypothetical protein  43.75 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.100754 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1202  protein of unknown function DUF1236  44.29 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1291  protein of unknown function DUF1236  34.81 
 
 		 104 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2242  hypothetical protein  35.8 
 
 		 210 aa  41.6  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2752  protein of unknown function DUF1236  37.04 
 
 		 205 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3015  protein of unknown function DUF1236  37.04 
 
 		 205 aa  40.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>