29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2245 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2245  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  265  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.702566  normal  0.472151 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2520  hypothetical protein  99.26 
 
 		 135 aa  263  5.999999999999999e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2202  conserved hypothetical protein; putative secreted protein  85.19 
 
 		 135 aa  192  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.184904  normal  0.817106 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3735  hypothetical protein  68.37 
 
 		 135 aa  134  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.722442  normal  0.0462573 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4456  hypothetical protein  59.82 
 
 		 133 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696256 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3997  hypothetical protein  31.97 
 
 		 161 aa  87.8  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2190  hypothetical protein  36.36 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2142  hypothetical protein  36.36 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2903  hypothetical protein  39.45 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.203392  normal  0.153041 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0940  hypothetical protein  31.43 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0606896  hitchhiker  0.00778912 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0415  hypothetical protein  36.13 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0438215  hitchhiker  0.000233911 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0383  hypothetical protein  38.26 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00782707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1081  hypothetical protein  39.62 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129849 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5640  hypothetical protein  34.04 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00146587  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0934  hypothetical protein  31.03 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0919  hypothetical protein  35 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.404023  normal  0.0701309 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2359  hypothetical protein  34.06 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0847029  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1867  hypothetical protein  35.78 
 
 		 174 aa  52.4  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0724  hypothetical protein  30 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.108952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1032  hypothetical protein  33.87 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1905  hypothetical protein  34.07 
 
 		 183 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.539779 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2301  hypothetical protein  29.66 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2001  hypothetical protein  33.33 
 
 		 183 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05688  hypothetical protein  27.14 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3299  hypothetical protein  32.59 
 
 		 183 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.43455 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3971  hypothetical protein  33.07 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2396  hypothetical protein  32.59 
 
 		 193 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6041  hypothetical protein  26.67 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.970972  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0866  hypothetical protein  26.67 
 
 		 153 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.171288  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>