31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1035 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_1035  type II secretion system protein  100 
 
 
298 aa  586  1e-166  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1642  type II secretion system protein  79.53 
 
 
298 aa  496  1e-139  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.226081  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0911  type II secretion system protein  78.86 
 
 
298 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1035  type II secretion system protein  78.86 
 
 
298 aa  476  1e-133  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.124398 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1152  type II secretion system protein  58.84 
 
 
295 aa  354  7.999999999999999e-97  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1053  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  342  4e-93  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.380793  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1041  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  342  4e-93  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1047  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  342  4e-93  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  26.51 
 
 
282 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2640  type II secretion system protein  26.62 
 
 
316 aa  53.9  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  25.87 
 
 
316 aa  53.9  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  24.59 
 
 
310 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  25 
 
 
660 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  23.44 
 
 
309 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4347  type II secretion system protein  24.09 
 
 
275 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  24.24 
 
 
282 aa  50.4  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  28.03 
 
 
316 aa  49.3  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  21.18 
 
 
310 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  27.13 
 
 
320 aa  47  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  23.9 
 
 
317 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1042  Type II secretion system F domain protein  24.43 
 
 
313 aa  46.2  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.205171  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  27.04 
 
 
320 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  26.72 
 
 
320 aa  46.2  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4854  hypothetical protein  23.64 
 
 
295 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1343  type II secretion system protein  20.54 
 
 
256 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.753846 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55880  hypothetical protein  21.62 
 
 
294 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2912  type II secretion system protein  28.68 
 
 
320 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  22.34 
 
 
283 aa  43.1  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  23.68 
 
 
290 aa  42.7  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  26.62 
 
 
320 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2699  type II secretion system protein  23.21 
 
 
321 aa  42.7  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>