22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2071 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2071  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  272  1.0000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140777  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2875  hypothetical protein  48.31 
 
 
133 aa  99.4  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.191047  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1820  hypothetical protein  43.97 
 
 
136 aa  96.7  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.394206  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3560  hypothetical protein  44.35 
 
 
131 aa  93.2  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.549553  normal  0.183463 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3131  hypothetical protein  39.83 
 
 
135 aa  86.3  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437849  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1042  hypothetical protein  40.48 
 
 
141 aa  83.2  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.141033  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0894  hypothetical protein  44.8 
 
 
132 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3272  hypothetical protein  40.65 
 
 
133 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2218  hypothetical protein  38.33 
 
 
134 aa  80.5  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190244  normal  0.341322 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0596  hypothetical protein  37.93 
 
 
132 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0933  hypothetical protein  44 
 
 
132 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4457  hypothetical protein  44 
 
 
132 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00222547 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0629  hypothetical protein  37.07 
 
 
133 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.91146  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0997  hypothetical protein  42.4 
 
 
132 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.954295  hitchhiker  0.000000182894 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2926  hypothetical protein  42.98 
 
 
141 aa  77.4  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2281  hypothetical protein  37.07 
 
 
134 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03632  hypothetical protein  34.48 
 
 
139 aa  70.9  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2128  hypothetical protein  36.8 
 
 
133 aa  68.2  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0997  hypothetical protein  33.62 
 
 
135 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000000466996  unclonable  8.0025e-19 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5423  hypothetical protein  29.57 
 
 
134 aa  58.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3341  protein of unknown function DUF1486  28.35 
 
 
134 aa  53.9  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188642  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2768  hypothetical protein  30.99 
 
 
130 aa  40  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>