45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0298 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0298  flagellar basal body rod protein FlgB  100 
 
 
135 aa  279  8.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0255  flagellar basal body rod protein FlgB  52.8 
 
 
126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4212  flagellar basal body rod protein FlgB  51.56 
 
 
126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0151  flagellar basal body rod protein FlgB  50.78 
 
 
126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0135  flagellar basal body rod protein FlgB  50 
 
 
126 aa  123  7e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0263191  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1094  flagellar basal body rod protein FlgB  45.6 
 
 
125 aa  121  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.376721 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1144  flagellar basal body rod protein FlgB  46.83 
 
 
128 aa  118  3e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0735  flagellar basal body rod protein FlgB  44.62 
 
 
130 aa  117  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0317  flagellar basal body rod protein FlgB  43.41 
 
 
130 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.763946  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0024  flagellar basal body rod protein FlgB  44.53 
 
 
126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3673  flagellar basal body rod protein FlgB  47.5 
 
 
127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0349  flagellar basal body rod protein FlgB  42.64 
 
 
130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0740426 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0629  flagellar basal body rod protein FlgB  48.8 
 
 
129 aa  111  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0618  flagellar basal body rod protein FlgB  48.8 
 
 
129 aa  111  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0896138  normal  0.0941281 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0596  flagellar basal body rod protein FlgB  47.54 
 
 
129 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.244257 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1692  flagellar basal body rod protein FlgB  44.88 
 
 
128 aa  103  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.315615  normal  0.0176326 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3656  flagellar basal body rod protein FlgB  42.4 
 
 
126 aa  101  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.306825  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2965  flagellar basal body rod protein FlgB  32.52 
 
 
129 aa  59.7  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.157354 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2992  flagellar basal body rod protein FlgB  32.2 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2600  flagellar basal body rod protein FlgB  32.2 
 
 
127 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000530741 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1331  flagellar basal body rod protein FlgB  32.77 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.754656  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4524  flagellar basal body rod protein  57.45 
 
 
119 aa  57  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.996777  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3437  putative flagellar basal-body rod protein FlgB  29.57 
 
 
139 aa  54.3  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2570  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.93 
 
 
142 aa  53.5  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4198  flagellar basal body rod protein FlgB  35.4 
 
 
117 aa  51.2  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5538  flagellar basal body rod protein FlgB  28.1 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.407776  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2235  flagellar basal body rod protein FlgB  30.77 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5155  flagellar basal body rod protein FlgB  29.27 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18507  normal  0.0554322 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2826  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.36 
 
 
152 aa  47.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1576  flagellar basal body rod protein FlgB  33.65 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2110  flagellar basal body rod protein FlgB  29.59 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.132503 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3247  flagellar basal body rod protein FlgB  25.44 
 
 
126 aa  45.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.896474  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0356  flagellar basal body rod protein FlgB  28.43 
 
 
155 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1392  flagellar basal body rod protein FlgB  30.7 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154079  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2000  flagellar basal body rod protein FlgB  31.65 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1366  flagellar basal body rod protein FlgB  27.27 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1271  flagellar basal-body rod protein FlgB  38.03 
 
 
115 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232017  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2134  flagellar basal body protein-like protein  29.77 
 
 
126 aa  40.8  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0795  flagellar basal body rod protein  31.3 
 
 
112 aa  40.8  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0940077  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2924  flagellar basal-body rod protein FlgB  40.74 
 
 
134 aa  40.4  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1587  flagellar basal body rod protein FlgB  43.14 
 
 
138 aa  40.4  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3026  flagellar basal body rod protein FlgB  28.95 
 
 
136 aa  40.8  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0342  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.88 
 
 
165 aa  40.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395119  normal  0.980929 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2284  flagellar basal body rod protein FlgB  28.57 
 
 
136 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2665  flagellar basal body rod protein FlgB  29.41 
 
 
136 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>