35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2571 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2571  protein of unknown function DUF450  100 
 
 
268 aa  543  1e-153  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.280266  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0296  hypothetical protein  34.88 
 
 
375 aa  75.9  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0986  hypothetical protein  34.17 
 
 
372 aa  71.6  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.432153  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0242  protein of unknown function DUF450  27.36 
 
 
370 aa  67.8  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0515  protein of unknown function DUF450  35.79 
 
 
360 aa  65.1  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0510  hypothetical protein  36.84 
 
 
349 aa  64.3  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0709  hypothetical protein  31.63 
 
 
382 aa  59.7  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3361  putative restriction endonuclease or methylase  27.68 
 
 
355 aa  55.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3005  hypothetical protein  27.68 
 
 
351 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.826636  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2724  hypothetical protein  29.91 
 
 
272 aa  55.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.380628  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1111  hypothetical protein  23.78 
 
 
357 aa  54.3  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0961  hypothetical protein  24.03 
 
 
354 aa  52  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0478229  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1839  hypothetical protein  23.94 
 
 
356 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00358423  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1326  hypothetical protein  22.91 
 
 
361 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1227  hypothetical protein  26.81 
 
 
356 aa  51.6  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.888396  normal  0.616229 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1887  hypothetical protein  23.94 
 
 
356 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.132794  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1853  hypothetical protein  23.94 
 
 
356 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0250  hypothetical protein  26.53 
 
 
380 aa  52  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.178621  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3350  protein of unknown function DUF450  25.75 
 
 
363 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6984  protein of unknown function DUF450  25.25 
 
 
362 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00893267  hitchhiker  0.0000001532 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3528  protein of unknown function DUF450  31.31 
 
 
375 aa  50.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0402721  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4924  hypothetical protein  25.83 
 
 
361 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1719  Uncharacterized protein possibly involved in aromatic compounds catabolism  100 
 
 
107 aa  49.7  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3617  hypothetical protein  26.83 
 
 
363 aa  49.7  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4039  hypothetical protein  24.72 
 
 
353 aa  49.7  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.400799  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1591  hypothetical protein  22.97 
 
 
365 aa  49.7  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.330641 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1269  protein of unknown function DUF450  23.68 
 
 
356 aa  49.3  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0165219  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5317  protein of unknown function DUF450  22.76 
 
 
364 aa  46.6  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0984182  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0499  hypothetical protein  23.33 
 
 
357 aa  46.6  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0768136  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3124  protein of unknown function DUF450  28.57 
 
 
363 aa  46.2  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579922  normal  0.419432 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0837  conserved hypothetical protein (DUF450 domain protein)  22.5 
 
 
347 aa  44.7  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000053845  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0378  stress protein, tellurium resistance TerD  25.77 
 
 
428 aa  43.5  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  24.29 
 
 
1250 aa  42.4  0.008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0789  hypothetical protein  24.29 
 
 
1250 aa  42.4  0.008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4887  hypothetical protein  22.83 
 
 
387 aa  42.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.180443  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>