48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0622 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0622  Iron sulfur domain-containing, CDGSH-type  100 
 
 
68 aa  139  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.507556 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2798  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  76.12 
 
 
70 aa  109  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.755848 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0783  Iron sulfur domain-containing, CDGSH-type  52.24 
 
 
76 aa  79.3  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.396298  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2157  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  50.75 
 
 
71 aa  71.6  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3258  Zinc finger, CDGSH-type  44.26 
 
 
86 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.167004  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1986  zinc finger CDGSH-type domain protein  50 
 
 
90 aa  58.2  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5202  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  43.1 
 
 
66 aa  56.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4406  hypothetical protein  39.39 
 
 
74 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00107323  normal  0.281597 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2069  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  49.15 
 
 
146 aa  54.3  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1683  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  46.03 
 
 
76 aa  53.9  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.362742 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2314  hypothetical protein  39.44 
 
 
232 aa  52  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3576  hypothetical protein  37.97 
 
 
256 aa  51.6  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.327098  normal  0.196355 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1270  hypothetical protein  42.62 
 
 
215 aa  51.2  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7318  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3158  zinc finger CDGSH-type domain protein  44.26 
 
 
74 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000868245 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2809  zinc finger CDGSH-type domain protein  44.26 
 
 
74 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3395  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  58.14 
 
 
104 aa  50.8  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2272  hypothetical protein  42.62 
 
 
211 aa  50.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2759  zinc finger CDGSH-type domain protein  43.86 
 
 
65 aa  50.8  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2912  hypothetical protein  49.15 
 
 
75 aa  50.4  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.213928  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1411  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  40 
 
 
53 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0321891 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0466  Iron sulfur domain-containing, CDGSH-type  54.29 
 
 
77 aa  47.8  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.336392  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2298  hypothetical protein  38.03 
 
 
241 aa  47.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.561327 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5171  hypothetical protein  56.41 
 
 
594 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0902166  hitchhiker  0.00324172 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13110  iron-binding zinc finger protein, CDGSH type  41.27 
 
 
104 aa  47.8  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1475  protein of unknown function DUF1271  36.11 
 
 
233 aa  47.4  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122746  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2269  zinc finger CDGSH-type domain protein  40.35 
 
 
70 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0871  protein of unknown function DUF1271  39.29 
 
 
599 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207432  normal  0.190699 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0355  Iron sulphur domain-containing, CDGSH-type  41.82 
 
 
72 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0145  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  36.23 
 
 
236 aa  46.2  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0865  protein of unknown function DUF1271  34.33 
 
 
219 aa  46.6  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000589964  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1281  protein of unknown function DUF1271  37.14 
 
 
233 aa  46.2  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.768741  normal  0.722249 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1178  protein of unknown function DUF1271  38.57 
 
 
233 aa  45.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.25383  normal  0.606867 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0591  zinc finger CDGSH-type domain protein  66.67 
 
 
229 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0856  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  39.06 
 
 
75 aa  45.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3468  Iron sulfur domain-containing, CDGSH-type  39.29 
 
 
71 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0516  hypothetical protein  37.29 
 
 
211 aa  43.9  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0782  protein of unknown function DUF1271  40.32 
 
 
214 aa  43.5  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2058  zinc finger CDGSH-type domain protein  32.35 
 
 
246 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000110219  normal  0.493607 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1437  protein of unknown function DUF1271  39.62 
 
 
147 aa  42  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.781813  normal  0.13067 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4177  hypothetical protein  33.82 
 
 
130 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3849  hypothetical protein  33.82 
 
 
130 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4016  hypothetical protein  33.82 
 
 
130 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3863  hypothetical protein  33.82 
 
 
130 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4330  hypothetical protein  33.82 
 
 
88 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3589  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  50 
 
 
84 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.558971  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2426  zinc finger CDGSH-type domain protein  51.35 
 
 
74 aa  40.8  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0623545  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2807  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  30.88 
 
 
80 aa  40.4  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.471751  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1927  zinc finger CDGSH-type domain protein  39.22 
 
 
82 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138644  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>