60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5423 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011758  Mchl_5423    100 
 
 		 348 bp  690    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.802579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6452  transposase IS3/IS911 family protein  90.64 
 
 		 375 bp  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5506  transposase IS3/IS911 family protein  89.18 
 
 		 375 bp  385  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5452  transposase IS3/IS911 family protein  89.18 
 
 		 375 bp  385  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0639  transposase IS3/IS911  85.37 
 
 		 375 bp  242  5e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.198474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3087  putative transposase  85.37 
 
 		 375 bp  242  5e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.809013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2867  transposase IS3/IS911  85.37 
 
 		 375 bp  242  5e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2820  transposase IS3/IS911  85.37 
 
 		 375 bp  242  5e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2673  transposase IS3/IS911  85.37 
 
 		 375 bp  242  5e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2666  transposase IS3/IS911  85.37 
 
 		 375 bp  242  5e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0465233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2357  transposase IS3/IS911  85.37 
 
 		 375 bp  242  5e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0428135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2136  transposase IS3/IS911  85.37 
 
 		 375 bp  242  5e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2100  transposase IS3/IS911  85.37 
 
 		 375 bp  242  5e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2081  transposase IS3/IS911  85.37 
 
 		 375 bp  242  5e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2046  transposase IS3/IS911  85.37 
 
 		 375 bp  242  5e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1965  transposase IS3/IS911  85.37 
 
 		 375 bp  242  5e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1931  transposase IS3/IS911  85.37 
 
 		 375 bp  242  5e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0659  transposase IS3/IS911  85.37 
 
 		 375 bp  242  5e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1491  transposase IS3/IS911  85.37 
 
 		 375 bp  242  5e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0660911  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1298  transposase IS3/IS911  85.37 
 
 		 330 bp  242  5e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0783  transposase IS3/IS911  85.37 
 
 		 375 bp  242  5e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.857983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0866  transposase IS3/IS911  85.37 
 
 		 375 bp  242  5e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1017  transposase IS3/IS911  85.37 
 
 		 375 bp  242  5e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0871  transposase IS3/IS911  85.37 
 
 		 375 bp  242  5e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.433518 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1944  transposase IS3/IS911  85.37 
 
 		 375 bp  242  5e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2330  transposase IS3/IS911  85.03 
 
 		 375 bp  234  1e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.449623  normal  0.490803 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3113  transposase IS3/IS911  85.03 
 
 		 375 bp  234  1e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1263  transposase IS3/IS911  83.7 
 
 		 366 bp  186  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1191    83.7 
 
 		 367 bp  186  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.737931  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4140  transposase IS3/IS911  88.62 
 
 		 402 bp  180  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2408  transposase IS3/IS911  91.11 
 
 		 375 bp  172  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.285932  normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1144  transposase IS3/IS911  91.11 
 
 		 375 bp  172  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.731855 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1541  helix-turn-helix, Fis-type  91.11 
 
 		 1488 bp  172  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0869  transposase IS3/IS911  91.11 
 
 		 375 bp  172  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.428884 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0254  helix-turn-helix, Fis-type  91.11 
 
 		 2358 bp  172  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2434  transposase IS3/IS911  91.11 
 
 		 375 bp  172  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0591246 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2864  transposase IS3/IS911  91.11 
 
 		 375 bp  172  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3105  transposase IS3/IS911  91.11 
 
 		 375 bp  172  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3099  helix-turn-helix, Fis-type  91.11 
 
 		 1440 bp  172  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2942  transposase IS3/IS911  91.11 
 
 		 375 bp  172  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.95779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2880  transposase IS3/IS911  91.11 
 
 		 375 bp  172  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.301854  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1262    90.65 
 
 		 204 bp  133  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3959  transposase IS3/IS911  86.96 
 
 		 285 bp  131  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.546667  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6151    89.42 
 
 		 243 bp  119  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.165176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3825  transposase IS3/IS911  86.92 
 
 		 390 bp  101  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5395  transposase IS3/IS911 family protein  80.18 
 
 		 300 bp  93.7  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8059  transposase  80.63 
 
 		 375 bp  85.7  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.877817  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9019  transposase  80.63 
 
 		 375 bp  85.7  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9079  transposase  80.63 
 
 		 375 bp  85.7  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4903  transposase IS3/IS911 family protein  84.62 
 
 		 387 bp  79.8  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.294667 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1261  transposase IS3/IS911  89.83 
 
 		 162 bp  69.9  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5091  hypothetical protein  83.84 
 
 		 195 bp  69.9  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.774813 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0499    92.86 
 
 		 1072 bp  60  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3374    88.46 
 
 		 186 bp  56  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.689929  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2356  protein related to arylsulfate sulfotransferase involved in siderophore biosynthesis  92.11 
 
 		 447 bp  52  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0870  helix-turn-helix, Fis-type  92.11 
 
 		 1062 bp  52  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.465972 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3088  hypothetical protein  92.11 
 
 		 351 bp  52  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.60135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0867  hypothetical protein  92.11 
 
 		 693 bp  52  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3946  ribonuclease, Rne/Rng family  100 
 
 		 3198 bp  46.1  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.213913 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2470  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 1179 bp  46.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.5015 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>