37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1262 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1262    100 
 
 
204 bp  404  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6452  transposase IS3/IS911 family protein  93.1 
 
 
375 bp  167  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5423    90.65 
 
 
348 bp  133  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.802579  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6151    90.2 
 
 
243 bp  123  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.165176  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5506  transposase IS3/IS911 family protein  86.96 
 
 
375 bp  109  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5452  transposase IS3/IS911 family protein  86.96 
 
 
375 bp  109  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2100  transposase IS3/IS911  88.31 
 
 
375 bp  81.8  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3087  putative transposase  88.31 
 
 
375 bp  81.8  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.809013  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2867  transposase IS3/IS911  88.31 
 
 
375 bp  81.8  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2820  transposase IS3/IS911  88.31 
 
 
375 bp  81.8  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2673  transposase IS3/IS911  88.31 
 
 
375 bp  81.8  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2666  transposase IS3/IS911  88.31 
 
 
375 bp  81.8  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0465233  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2357  transposase IS3/IS911  88.31 
 
 
375 bp  81.8  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0428135  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0639  transposase IS3/IS911  88.31 
 
 
375 bp  81.8  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.198474  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2136  transposase IS3/IS911  88.31 
 
 
375 bp  81.8  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2081  transposase IS3/IS911  88.31 
 
 
375 bp  81.8  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2046  transposase IS3/IS911  88.31 
 
 
375 bp  81.8  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1965  transposase IS3/IS911  88.31 
 
 
375 bp  81.8  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1944  transposase IS3/IS911  88.31 
 
 
375 bp  81.8  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1931  transposase IS3/IS911  88.31 
 
 
375 bp  81.8  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1491  transposase IS3/IS911  88.31 
 
 
375 bp  81.8  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0660911  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1298  transposase IS3/IS911  88.31 
 
 
330 bp  81.8  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1017  transposase IS3/IS911  88.31 
 
 
375 bp  81.8  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0871  transposase IS3/IS911  88.31 
 
 
375 bp  81.8  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.433518 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0866  transposase IS3/IS911  88.31 
 
 
375 bp  81.8  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0783  transposase IS3/IS911  88.31 
 
 
375 bp  81.8  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.857983  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0659  transposase IS3/IS911  88.31 
 
 
375 bp  81.8  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2330  transposase IS3/IS911  87.01 
 
 
375 bp  73.8  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.449623  normal  0.490803 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3113  transposase IS3/IS911  87.01 
 
 
375 bp  73.8  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2356  protein related to arylsulfate sulfotransferase involved in siderophore biosynthesis  94.74 
 
 
447 bp  60  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876457  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3088  hypothetical protein  94.74 
 
 
351 bp  60  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.60135  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0870  helix-turn-helix, Fis-type  94.74 
 
 
1062 bp  60  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.465972 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0867  hypothetical protein  94.74 
 
 
693 bp  60  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8059  transposase  100 
 
 
375 bp  56  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.877817  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9019  transposase  100 
 
 
375 bp  56  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9079  transposase  100 
 
 
375 bp  56  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3825  transposase IS3/IS911  85.71 
 
 
390 bp  48.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>