47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6151 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6151    100 
 
 		 243 bp  482  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.165176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6452  transposase IS3/IS911 family protein  92.19 
 
 		 375 bp  174  6.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1262    90.2 
 
 		 204 bp  123  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5423    89.42 
 
 		 348 bp  119  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.802579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1191    88.29 
 
 		 367 bp  117  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.737931  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1263  transposase IS3/IS911  88.29 
 
 		 366 bp  117  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5452  transposase IS3/IS911 family protein  85.94 
 
 		 375 bp  111  9.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5506  transposase IS3/IS911 family protein  85.94 
 
 		 375 bp  111  9.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2666  transposase IS3/IS911  87.5 
 
 		 375 bp  95.6  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0465233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3113  transposase IS3/IS911  87.5 
 
 		 375 bp  95.6  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3087  putative transposase  87.5 
 
 		 375 bp  95.6  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.809013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2867  transposase IS3/IS911  87.5 
 
 		 375 bp  95.6  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2820  transposase IS3/IS911  87.5 
 
 		 375 bp  95.6  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2673  transposase IS3/IS911  87.5 
 
 		 375 bp  95.6  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2357  transposase IS3/IS911  87.5 
 
 		 375 bp  95.6  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0428135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2330  transposase IS3/IS911  87.5 
 
 		 375 bp  95.6  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.449623  normal  0.490803 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2136  transposase IS3/IS911  87.5 
 
 		 375 bp  95.6  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2081  transposase IS3/IS911  87.5 
 
 		 375 bp  95.6  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0639  transposase IS3/IS911  87.5 
 
 		 375 bp  95.6  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.198474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0659  transposase IS3/IS911  87.5 
 
 		 375 bp  95.6  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0783  transposase IS3/IS911  87.5 
 
 		 375 bp  95.6  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.857983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0866  transposase IS3/IS911  87.5 
 
 		 375 bp  95.6  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0871  transposase IS3/IS911  87.5 
 
 		 375 bp  95.6  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.433518 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1017  transposase IS3/IS911  87.5 
 
 		 375 bp  95.6  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1298  transposase IS3/IS911  87.5 
 
 		 330 bp  95.6  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1491  transposase IS3/IS911  87.5 
 
 		 375 bp  95.6  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0660911  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2100  transposase IS3/IS911  87.5 
 
 		 375 bp  95.6  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2046  transposase IS3/IS911  87.5 
 
 		 375 bp  95.6  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1965  transposase IS3/IS911  87.5 
 
 		 375 bp  95.6  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1931  transposase IS3/IS911  87.5 
 
 		 375 bp  95.6  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1944  transposase IS3/IS911  87.5 
 
 		 375 bp  95.6  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3825  transposase IS3/IS911  87.06 
 
 		 390 bp  81.8  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4140  transposase IS3/IS911  91.67 
 
 		 402 bp  63.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2450  transposase IS3/IS911  81.74 
 
 		 174 bp  61.9  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0254  helix-turn-helix, Fis-type  89.58 
 
 		 2358 bp  56  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2408  transposase IS3/IS911  89.58 
 
 		 375 bp  56  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.285932  normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0869  transposase IS3/IS911  89.58 
 
 		 375 bp  56  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.428884 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2434  transposase IS3/IS911  89.58 
 
 		 375 bp  56  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0591246 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0499    94.44 
 
 		 1072 bp  56  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2864  transposase IS3/IS911  89.58 
 
 		 375 bp  56  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1144  transposase IS3/IS911  89.58 
 
 		 375 bp  56  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.731855 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3105  transposase IS3/IS911  89.58 
 
 		 375 bp  56  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3099  helix-turn-helix, Fis-type  89.58 
 
 		 1440 bp  56  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2942  transposase IS3/IS911  89.58 
 
 		 375 bp  56  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.95779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2880  transposase IS3/IS911  89.58 
 
 		 375 bp  56  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.301854  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1541  helix-turn-helix, Fis-type  89.58 
 
 		 1488 bp  56  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5395  transposase IS3/IS911 family protein  87.23 
 
 		 300 bp  46.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182536  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>